Kayın Mantarı (Pleurotus ostreatus) Genomunda ABC Proteinlerinden MDR Alt Ailesinin Biyoinformatik Analizi ve İfade Profili

Authors : Hatice Kübra DÜZEL, Birsen ÇAKIR AYDEMİR

Pages : 72-82

Doi:10.53501/rteufemud.1017979

View : 21 | Download : 14

Publication Date : 2021-12-31

Article Type : Research Paper

Abstract :Hücre zarında birçok farklı metabolik yolu kontrol eden yapılardan biri olan ve en büyük protein ailelerinden birini oluşturan ATP bağlayan kaset taşıyıcı proteinleri insert ignore into journalissuearticles values(ABC); ATP enerjisini kullanarak madde taşınımında görev alırlar. Çözünür ABC proteinleri transmembran taşınmasına dahil değildir, ancak hücresel süreçlerde, örneğin ribozom biyojenezi ve mRNA translasyonunda önemli bir rol oynamaktadır. ABC proteinlerinin bir alt ailesi olan çoklu ilaç direnci insert ignore into journalissuearticles values(MDR); alt ailesi, antimikrobiyal peptitler, lipit taşınması, feromon taşınması, mitokondriyal porfirin alımı, ökaryotik peptit taşınması, antijenlerin işlenmesi, oksidatif stresden korunma, ağır metal dayanıklılığı, v.b. olaylarda rol oynamaktadır. Bu çalışmada kayın mantarı insert ignore into journalissuearticles values(Pleurotus osteradus); genomunun biyoinformatik analizi ile ABC proteinlerinin bir alt üyesi olan ABCB gen ailesine ait 8 tane MDR protein kodlayan gen insert ignore into journalissuearticles values(PoMDRs); belirlenmiştir. PoMDRs genlerinin kodladığı proteinler ile filogenetik ağaç oluşturulmuştur. Ayrıca bu çalışma kapsamında ilk defa sap ve şapkada PoMDR genlerinin ifade seviyeleri incelenmiş ve bu genlerin ifade düzeylerinin benzer profillere sahip oldukları ancak bu genlerin ifade seviyelerinin şapkada daha fazla olduğu tespit edilmiştir.
Keywords : ABC Kaset Taşıyıcıları, MDR Alt Ailesi, mRNA İfadesi, Pleurotus Ostreatus, Kayın mantarı