Bazı Poaceae üyelerinde arpa ve buğday EST-mikrosatellit markırlarının aktarılabilirliği

Authors : HÜLYA SİPAHİ, Yeliz Aslan, Ayşen Yumurtacı

Pages : 102-113

View : 44 | Download : 10

Publication Date : 2016-12-31

Article Type : Research Paper

Abstract :Normal 0 21 false false false MicrosoftInternetExplorer4 /* Style Definitions */ table.MsoNormalTable {mso-style-name:`Normal Tablo`; mso-tstyle-rowband-size:0; mso-tstyle-colband-size:0; mso-style-noshow:yes; mso-style-parent:``; mso-padding-alt:0cm 5.4pt 0cm 5.4pt; mso-para-margin:0cm; mso-para-margin-bottom:.0001pt; mso-pagination:widow-orphan; font-size:10.0pt; font-family:`Times New Roman`; mso-ansi-language:#0400; mso-fareast-language:#0400; mso-bidi-language:#0400;} Fusariım enfeksiyon koşulları altında oluşturulmuş eksprese olan dizi insert ignore into journalissuearticles values(EST); kütüphanelerinden geliştirilen arpa ve buğday mikrosatellit markırlarının türler/cinsler arası aktarılabilirlikleri, 8 Aegilops , 6 Triticum türü ile , Zea mays, Avena sativa ve Oryza sativa ‘yı içeren 17 türde belirlenmiştir. Arpa mikrosatellit primerleri için aktarılabilirlik oranı %29 ila %100 arasında değişmiştir. Cinsler arası en yüksek insert ignore into journalissuearticles values( %100); aktarılabilirlik   Avena da not edilmiş, bunu Zea insert ignore into journalissuearticles values(%92); , Triticum insert ignore into journalissuearticles values( %83); , Aegilops insert ignore into journalissuearticles values(68%); ve Oryza insert ignore into journalissuearticles values(%8); takip etmiştir. Primer çiftleri,   Triticum türleri içerinde oldukça yüksek aktarılabilirdir insert ignore into journalissuearticles values( T. turgidum durum durum da %100, T. turgidum durum dicoccon ve T. monococcum aegilopoides da %92 ,T.timopheevii timopheevii ve T. turgidum dicoccoides de %83 , T. timopheevii armeniacum da %67);. Yalnızca bir primer çifti insert ignore into journalissuearticles values(contig624); çalışılan tüm materyallerde, %100 tür/cinsler arası çoğaltım göstermiştir. Buğday mikrosatellitleri değerlendirildiğinde, mikrosatellit primer çiftleri Triticum türleri içinde oldukça aktarılabilirdir insert ignore into journalissuearticles values(%70 ila %100 arasında); ancak akraba tahıllarda düşük aktarılabilirdir insert ignore into journalissuearticles values( Avena da 15%, Oryza da 50%, Zea da 45%, Hordeum da 60%);. İki primer çifti yalnızca bazı Triticum türlerinde aktarılabilirlik göstermişken, diğer iki primer çifti sadece Aegilops ve Triticum türlerinde çoğaltım göstermiştir. EST mikrosatellite markırlarının bu yüksek tür/cinsler arası aktarılabilirliği, genomun ifade edilen bölgesine ait DNA diziliminin yüksek derecede korunduğunu ve bunların karşılaştırılmalı genom haritalamalarında, genetik çeşitlilikte ve filogenetik analizlerde uygunluklarını göstermektedir.
Keywords : mikrosatellit marker, aktarılabilirlik, tahıl

ORIGINAL ARTICLE URL