Multikonik Simülasyon Yöntemi ile Peptidlerin Sıvı İçindeki Yapılarını İncelenmesi

Tropoelastin molekülünün en önemli tekrar motifi olan Val–Pro-Gly-Val-Gly diziliminin sıvı içindeki yapısı multikanonik simülasyon yöntemi ile elde edilmistir ve düsük enerjili ve termodinamik olarak kararlı yapıları belirlenmistir. Sıvı teriminin yapılar üstündeki etkisi Ramachandran grafikleri ile analiz edilmistir. Sıvı teriminin moleküle esneklik getirdigi, vakum içinde çok sınırlı bir bölgeye hapsolmus bulunan konfigürasyonların sıvı içinde degistigi gözlenmistir. Sıvı içinde besli-peptidin sahip oldugu en düsük enerji degeri belirlenmistir.