Schiff Bazı İçeren Tek Kristal Bileşik Üzerinde X-Işınları, Spektroskopik ve Moleküler Doking Çalışmaları

Authors : Tuncay KARAKURT, Seher MERAL, Ayşen ALAMAN AĞAR

Pages : 505-514

Doi:10.19113/sdufenbed.530279

View : 22 | Download : 16

Publication Date : 2019-08-25

Article Type : Research Paper

Abstract :Schiff bazı ve tiyazol halkası içeren 2,2`-insert ignore into journalissuearticles values(insert ignore into journalissuearticles values(1E,1`E);-insert ignore into journalissuearticles values(ethan-1,2-dibisinsert ignore into journalissuearticles values(azaneliden););bisinsert ignore into journalissuearticles values(methaneliden););bisinsert ignore into journalissuearticles values(4-insert ignore into journalissuearticles values(trifloromethoksi);fenol tek kristali bu çalışmada sentezlenmiştir. Sentezlenen kristalin yapısı, IR spektroskopik ve X-ışınları analizi teknikleri kullanılarak aydınlatılmıştır. İncelenen bileşiğin fenol–imin ve keto–amin gibi iki farklı tautomer formda olabileceği görülmüştür. Deneysel ve teorik tüm çalışmalar iki tautomer yapı üzerinde yapılmıştır. Bunun içinde bileşiğin yapısal parametreleri, GAUSSIAN 09W paket programı ve DFT/B3LYP teorisi ile optimize edildikten sonra IRC insert ignore into journalissuearticles values(intrinsic reaction coordinate);, frontier moleküler orbitalinsert ignore into journalissuearticles values(FMO); hesaplamaları yapılmıştır. IRC çalışmasında fenol-imin formunun keto-amin formuna göre daha düşük enerjiye sahip olduğu gözlenmiş olup iki form arasındaki enerji farkı -14.71 kj/mol olarak hesaplanmıştır. Ayrıca, fenol-imin ve keto-amin formlarına ait HOMO enerji değerleri sırasıyla, -6.31 ve -5.77 eV olarak hesaplanmıştır. Son olarak da iki tautomer yapının antifungal aktivite çalışmaları için 2RKV protein yapısına inhibitör ajan olabilmesi yönünde Moleküler Doking çalışması yapılmıştır. Bu hesaplama sonucunda fenol-imin ve keto-amin formuna ait affinite değerleri insert ignore into journalissuearticles values(Doking skoru); sırasıyla, -7.7 ve -7.3 kcal/mol olarak elde edilmiş olup HOMO orbital enerjileri ile affinite değerlerinin orantılı olduğu çalışmamızda gözlenmiştir.
Keywords : Gaussian 09W, Fenolimin, Ketoamin, Moleküler doking