Bromukonazol’ ün Moleküler Etkileşim Mekanizmasının DFT ve Moleküler Kenetleme Yöntemleri İle Açıklanması

Authors : Neslihan KAYA KINAYTÜRK

Pages : 266-272

Doi:10.19113/sdufenbed.1213761

View : 47 | Download : 51

Publication Date : 2023-08-25

Article Type : Research Paper

Abstract :İnsanlar için kanserojen potansiyeli yüksek olan Bromukonazol fungisitinin kuantum kimyasal hesaplamaları yapılarak yapı karakterizasyonunun aydınlatılmasının yanı sıra DNA proteini insert ignore into journalissuearticles values(PDB ID: 1BNA); ile moleküler kenetleme analizi yapıldı. Yoğunluk Fonksiyonel Teorisi insert ignore into journalissuearticles values(DFT); yöntemi B3LYP fonksiyoneli ve aug-ccpVDZ temel seti kullanılarak Gaussian09 programında optimize edildi. Zamana bağlı DFT insert ignore into journalissuearticles values(TD-DFT); yöntemi ile HOMO, LUMO enerjileri hesaplandı. Protein veri bankasından 1BNA proteinin kristal yapısı *.pdb formatında temin edildi ve ligandın optimize edilmiş geometrisi kullanılarak ligand ile proteinin etkileşimi AutoDock Vina programında analiz edildi. Moleküler kenetlenme çalışmaları sonucu, ligand-protein bağlanma enerjileri, ligand-protein arasında oluşabilecek hidrojen bağ bölgeleri ve sayısı tespit edilerek moleküler etkileşim mekanizması açıklanmıştır.
Keywords : DFT, Moleküler Kenetlenme, Bromukanazol, HOMO LUMO