Investigation of Potential Antibacterial Properties of Some Azo Compounds by Molecular Docking Method

Authors : Çiğdem KARABACAK ATAY, Tahir TİLKİ, Bülent DEDE

Pages : 150-154

Doi:10.29233/sdufeffd.544174

View : 20 | Download : 15

Publication Date : 2019-05-31

Article Type : Research Paper

Abstract :Bu çalışmada, önceki çalışmalarımızda sentezlediğimiz  üç azo boyarmaddenin, 2 - [insert ignore into journalissuearticles values(3,5-diamino-1H-pirazol-4-il);diazenil]-5-nitrobenzoik asit insert ignore into journalissuearticles values(A);, 2-[insert ignore into journalissuearticles values(3,5);-dimetil-1H-pirazol-4-il); diazenil]-5-nitrobenzoik asit insert ignore into journalissuearticles values(B); ve 2-[insert ignore into journalissuearticles values(5-amino-3-metil-1H-pirazol-4-il); diazenil]-5-nitrobenzoik asit insert ignore into journalissuearticles values(C);, potansiyel antibakteriyel özelliklerini araştırmak için moleküler doking çalışmaları yapıldı. Modelleme, SwissDock web sunucusunda EADock DSS algoritması kullanılarak gerçekleştirildi. Olası bağlanma konformasyonları ve inhibe edici etkileri belirlemek için E . coli beta-ketoaçil-açil taşıyıcı protein sentaz III insert ignore into journalissuearticles values(KAS III); aktif bölgesine ligandların insert ignore into journalissuearticles values(A, B ve C); bağlanma simülasyonları yapıldı. Doking sonuçları ayrıca ticari bir antibakteriyel madde olarak kullanılan triklosan ile karşılaştırıldı ve B bileşiğinin en iyi antibakteriyel özelliğe sahip olduğu bulundu.
Keywords : Moleküler kenetlenme, Azo bileşik, Antibakteriyel özellikler, Protein