Türkiye şeker pancarı üretim alanlarına ait Beet necrotic yellow vein virus izolatlarının kılıf protein genine göre moleküler karakterizasyonu

Authors : Ebru Erkan, Nazlı Dide Kutluk Yılmaz

Pages : 21-32

Doi:10.33409/tbbbd.1637444

View : 56 | Download : 29

Publication Date : 2025-06-15

Article Type : Research Paper

Abstract :Şeker pancarı üretim alanlarında sıklıkla rastlanan, en fazla zarar oluşturan toprak kökenli virüs türü Beet necrotic yellow vein virus (BNYVV) olup \\\'rhizomania\\\' olarak bilinen hastalığa neden olmakta ve toprak kökenli vektör Polymyxa betae ile taşınmaktadır. Bu çalışmada, Türkiye’nin farklı bölgelerinden elde edilen ve BNYVV ile bulaşık olduğu daha önce belirlenen 17 toprak örneği kullanılmıştır. Öncelikle, tuzak bitki testi yöntemine göre BNYVV izolatlarının yeniden çoğaltımı sağlanmıştır. Kılıf protein (CP) geni BNYVV’nin RNA-2 segmentinden sentezlenmektedir. Bu çalışmada 16 BNYVV izolatının CP gen bölgesinin nükleotit dizileri elde edilmiştir. Bu izolatların dünya izolatları ile BLAST analizi ve elde edilen filogenetik analizler sonucu, ülkemize ait BNYVV izolatlarının iki farklı gruba ayrıldıkları saptanmıştır. İlk grupta yer alan IGR-9 ve ERC-52 izolatlarının, A (P) tipi CP yapısına sahip Çin, Fransa ve İran’a ait bahsedildiği sıraya göre, HXL291CP-1, Pithiviers ve IR-GR1 izolatlarıyla %99.65 oran ile en yüksek benzerliğe sahip olduğu belirlenmiştir. İkinci grupta yer alan diğer 14 BNYVV izolatı ise, A-tip karakterde CP içeren İspanya, ABD ve Sırbistan’a ait BNYVV izolatları ile en yüksek benzerlik göstermişlerdir (%99.65-%100).
Keywords : Rhizomania, CP, RT-PCR, sekans analizi

ORIGINAL ARTICLE URL