In silico analysis of quercetin, gallic acid, oleanolic acid, and ursolic acid on diabetes mellitus

Authors : Merve ARAS, Özlem YAYINTAŞ

Pages : 100-110

Doi:10.55665/troiamedj.1163784

View : 64 | Download : 9

Publication Date : 2022-09-30

Article Type : Research Paper

Abstract :Amaç: Diyabet, pankreatik β hücrelerinin yeterli seviyede insülin üretememesin ya da üretilen insülinin vücut tarafından etkili şekilde kullanılamaması sonucu ortaya çıkan bir hastalıktır. IDF diyabet atlasının verilerine göre 2021’de dünya çapında 20-79 yaş aralığında 537 milyon diyabetli hasta olduğu ve bu sayının 2030’da 643 milyon, 2045’te ise 783 milyon olmasının beklendiği bildirilmiştir. Bu derece ciddi düzeyde olan diyabet hastalığını kontrol altına alabilmek için bilim insanları çeşitli tedavi yöntemleri bulmaya çalışmaktadır. Bunlardan biri de doğal tedavilerdir. Bu çalışmada, antidiyabetik özelliklere sahip quercetin, gallik asit, oleanolik asit ve ursolik asidin diyabetle ilişkili renin, katepsin-d, T-PA, leptin, MASP-2, FABP4 proteinlerine afinite değerleri araştırıldı. Yöntem: Moleküler docking analizi için öncelikle UCSF Chimera 1.15 yazılımı ile proteinlerden istenmeyen kalıntılar ve zincirler silinmiş ve polar hidrojen atomları eklenerek docking için hazırlanmıştır. Daha sonra ligand olarak kullanılan kuersetin, gallik asit, oleanolik asit ve ursolik asit minimum enerji konformasyonuna getirilmiştir. Moleküler yerleştirme için hazırlanan protein ve ligand, Autodock Tools 1.5.6 yazılımı ile analiz edildi. Moleküler yerleştirme sonuçları, BIOVIA Discovery Studio ve protein plus yazılımı ile görüntülendi. Ayrıca ADME analizi için pkCSM yazılımı kullanılmıştır. Sonuç: Sonuç olarak, quercetin diğer üç flavonoidden daha etkili bulunmuştur.
Keywords : flavonoidler, şeker hastalığı, ADME, moleküler yerleştirme

ORIGINAL ARTICLE URL