Investigation of DNA affinity levels of pesticides: docking analysis results

Authors : Merve ARAS, Özlem YAYINTAŞ, Sibel OYMAK YALÇIN

Pages : 1-8

Doi:10.55665/troiamedj.1137673

View : 15 | Download : 6

Publication Date : 2023-01-30

Article Type : Research Paper

Abstract :Amaç: Son yıllarda yapılan çalışmalara göre pestisitler kanser, Parkinson hastalığı, Alzheimer hastalığı, üreme sistemi bozuklukları ve doğum defektleri gelişimine yol açabilmektedir. Bu çalışmanın amacı Alfa-sipermetrin, Malathion, Quinclorac, Roundup insert ignore into journalissuearticles values(Glyphosate); bitki koruma ürünlerinin DNA afinite düzeylerini incelemek ve literatur eşliğinde tartışmaktır. Yöntem: Ligand ve reseptör arasındaki docking sonuçları Hex 8.0.0 yazılımı kullanılarak tespit edildi. Reseptör ve ligandın docking için hazırlanması UCSF Chimera 1.15 yazılımı ile yapıldı. Docking görselleştirmeleri BIOVIA Discovery Studio ve PyMol yazılımları ile yapıldı. Pestisitlerin DNA ile olan etkileşim görüntüleri BIOVIA Discovery Studio yazılımı ile tespit edilirken, DNA’ya bağlanma görüntüleri PyMol yazılımı ile tespit edildi. Bulgular: Çalışmamızda Çanakkale bölgesinde sık kullanılan bitki koruma ürünlerinin docking analiz sonuçlarına göre DNA molekülüne olan affinite düzeyleri sırasıyla Alpha Cypermethrin>Malathion>Quinclorac>Roundup/Glyphosate şeklinde tespit edildi. DNA ile en yüksek etkileşim içinde olan pestisit Alpha Cypermethrin insert ignore into journalissuearticles values(-248.24 KJ mol-1); ve en düşük bağlanma enerjili ise Roundup insert ignore into journalissuearticles values(-161.54 KJ mol-1); olarak tespit edildi. Sonuç: Alfa-sipermetrin literatürle de uyumlu olarak toksisistesi ve gen hasarı oluşturma potansiyeli en yüksek moleküldür. Ürün çeşitliliği göz önüne alındığında hem tekli hem de çoklu bitki koruma ürünleri kullanımına dikkat edilmesi gerekmektedir. Bu molekül kullanımı sırasında alternatif olarak yerine geçebilecek daha düşük DNA affinitesi ve toksisitesi olan bitki koruma ürünleri tercih edilebilir.
Keywords : moleküler docking, alfa sipermetrin, malathion, quinclorac, roundup glyphosate,