Molecular Phylogenetic Analysis Of Morkaraman Sheeps In Bingol Region

Authors : Oğuz AĞYAR, Emin ÖZKÖSE, Mehmet Sait EKİNCİ, İsmail AKYOL

Pages : 171-178

Doi:10.30910/turkjans.642421

View : 20 | Download : 16

Publication Date : 2021-01-23

Article Type : Research Paper

Abstract :Bu çalışmada, Morkaraman koyunlarının insert ignore into journalissuearticles values(Ovis aries); filogenetik ilişkileri mitokondriyal DNA insert ignore into journalissuearticles values(mtDNA); 16S rRNA gen dizisi analizi ile gerçekleştirilmiştir. Evcil koyunlarda, 16S rRNA geni 1574 baz çifti insert ignore into journalissuearticles values(bç); uzunluğundadır. Çalışmamızda mtDNA 16S rRNA gen bölgesi hedeflenerek, Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi insert ignore into journalissuearticles values(NCBI); alınan örnek sekansla insert ignore into journalissuearticles values(NC_001941.1); tasarlanan primerler ile, 536 bç’lik sekans ürünleri elde edilmiştir. Elde edilen diziler için homoloji araştırması, NCBI`de BLAST kullanılarak yapılmıştır. Çalışma sonunda elde ettiğimiz 16S rRNA gen bölgesi dizi bilgileri GenBank veri tabanına sırası ile bu erişim numaralarıyla yer almaktadır; Sırasıyla KU686952.1, KU686953.1, KU686954.1, KU686955.1, KU686956.1, KU686957.1, KU686958.1, KU686959.1, KU686960.1, KU686961.1 ve KU686962.1. Morkaraman koyun örnekleri insert ignore into journalissuearticles values(n=11); üzerinde yapılan analizler sonunda, mtDNA 16S rRNA gen bölgesi sekanslarından nükleotit farklılıkları bakımından 10 polimorfik bölge ve 8 haplotip bölge tespit edilmiştir. Tüm dizilerin nükleotit kompozisyon ortalamaları % 32.1 Adenin insert ignore into journalissuearticles values(A);, % 24.2 Timin insert ignore into journalissuearticles values(T);, % 22.2 Sitosin insert ignore into journalissuearticles values(C); ve % 21.5 Guanin insert ignore into journalissuearticles values(G);; G + C % 43.7 olarak bulundu. 16S rRNA gen dizileri, haplotip çeşitliliği insert ignore into journalissuearticles values(Hd); ve nükleotit çeşitliliğine insert ignore into journalissuearticles values(π); dayanan DNA polimorfizmi sırasıyla 0.9273 ± 0.00442 ve 0.00427 ± 0.00125 olarak bulunmuştur. Gen dizileri bilgisine dayanarak, koyunlarda, mtDNA haplotipleri, mtDNA polimorfizmi, haplotipleri arasındaki filogenetik ilişkiler ile belirlenen yerli ve yabancı koyun ırkları arasındaki filogenetik ilişkileri belirlenmiştir.
Keywords : Filogenetik, Genetik Çeşitlilik, Morkaraman Ovis aries,