Şanlıurfa Yöresi Akkaraman ve İvesi Koyunlarında Mitokondriyal Sitokrom b (Cyt b) Gen Dizisine Göre Filogenetik Analizler

Authors : Selahaddin KİRAZ, Mehmet EKİNCİ, Seyrani KONCAGÜL

Pages : 179-187

Doi:10.30910/turkjans.798488

View : 23 | Download : 12

Publication Date : 2021-01-23

Article Type : Other Papers

Abstract :Bu çalışmada, Şanlıurfa yöresindeki Akkaraman insert ignore into journalissuearticles values(AK); ve İvesi insert ignore into journalissuearticles values(IV); koyunlarının filogenetik yapıları moleküler tekniklerle belirlenmeye çalışılmıştır. Araştırmanın hayvan materyalini, Şanlıurfa ve yöresinde yetiştirilen Akkaraman insert ignore into journalissuearticles values(AK); ve İvesi insert ignore into journalissuearticles values(IV); koyunları oluşturmuştur. Koyunlardan genomik DNA izolasyonu için kıl örnekleri toplanmış ve tüm örneklerden genomik DNA izole edilmiştir. Koyun DNA örneklerinde mitokondriyal Sitokrom b insert ignore into journalissuearticles values(Cyt b); gen bölgelerini çoğaltmak için gerekli ileri ve geri primerler tasarlanmıştır. Koyun Cyt b gen bölgeleri polimeraz zincir reaksiyonu tekniği insert ignore into journalissuearticles values(PZR); ile çoğaltılmıştır. PZR ürünlerinin gen dizi bilgileri elde edilmiştir. Populasyonlar için toplam bölge sayısı, G+C oranı, polimorfik bölge sayısı insert ignore into journalissuearticles values(S);, haplotip sayısı insert ignore into journalissuearticles values(h);, haplotip farklılığı insert ignore into journalissuearticles values(Hd); ve nükleotid farklılığı insert ignore into journalissuearticles values(π); değerleri hesaplanmıştır. Koyun haplotiplere ait Cyt b gen dizileri ile referans diziler insert ignore into journalissuearticles values(A, B, C, D, ve E soyları); birlikte oluşturulan N-J filogenetik ağaçta, 16 haplotipten, 6’sı B soyunda insert ignore into journalissuearticles values(IV01, AK13, AK09, IV06, AK16, IV05);, 1’i A soyunda insert ignore into journalissuearticles values(IV12);, 1’i E soyunda insert ignore into journalissuearticles values(AK04); 5’i C soyunda insert ignore into journalissuearticles values(AK12, AK02, IV16, AK01, IV08, IV03); yer almış, AK06 ve IV13 farklı kümelenmiştir. Sonuç olarak, Şanlıurfa yöresi Akkaraman ve İvesi koyunları Cyt b gen bölgesi gen dizileri belirlenmiştir.
Keywords : Koyun, Filogenetik, mtDNA, Moleküler çalışmlar