MatK ve trnH-psbA Barkot Genleri Kullanılarak Bazı Bitki Taksonlarının Moleküler Olarak Sınıflandırılması

Authors : Behcet İNAL, Mehmet KARACA

Pages : 87-93

Doi:10.19159/tutad.488296

View : 22 | Download : 8

Publication Date : 2019-02-28

Article Type : Research Paper

Abstract :Canlıların sınıflandırılması ve canlı birliklerine ait sınırların çizilmesi gözleme ve deneye dayalı sistemli bilgi üretmeye başlanmasıyla birlikte karşılaşılan en karmaşık problemlerden biri olmuştur. Bu amaçla araştırmacılar birçok kuram ve metot geliştirerek var olan canlı çeşitliliğini saptamaya çalışmışlardır. Çekirdek kökenli barkot bölgeleri, plastid kökenli barkot bölgelerine göre çok daha fazla bilgi içermesine karşın, tek lokus kullanılarak barkotlama yapıldığında, farklı bitki gruplarını karşılaştırabilmek için yeterli bilgiye sahip olunmamaktadır. Tüm bitki türlerinde kullanılabilecek tek bir barkot bölgesi henüz mevcut değildir ve bu nedenle farklı barkot bölgelerinin birlikte kullanılması, türlerin ayırt edilebilme gücünü arttırabilmektedir. Çalışmanın ana hedefi, bitki moleküler filogenetiğini konu alan çalışmalarda etkin olarak kullanılabilecek gen, gen bölgesi ve gen sayısını değerlendirmektir. Bu çalışmada, 15 farklı bitki ailesine ait toplam 60 bitki türüne ait filogenetik ilişkiyi değerlendirmek için mat K, ve trn H -psb A barkot genler kullanılarak MAFFT insert ignore into journalissuearticles values(Multiple Alignment Using Fast Fourier Transform); yazılımı ile diziler hizalanmış ve Bayesian metodu ile konsensus filogenetik ağaç elde edilmiştir. Sonuçlar bitki moleküler filogenetik çalışmalarında mat K gen dizilerinin trn H -psb A gen dizilerine göre daha yüksek ardıl olasılık değerli ağaç üretebildiğini göstermiştir. Ancak daha fazla genlerin çalışması ile olası filogenetik ilişki daha da iyi bir şekilde tahmin edilebilir.
Keywords : Filogeni, moleküler sistematik, biyoinformatik, barkot gen