Kışlık Buğdaylarda Kök ve Kökboğazı Çürüklüğüne Sebep Olan Fusarium spp. İzolatları Arasındaki Genetik Varyasyonun Retrotranzpozon Temelli iPBS Markörleri ile İncelenmesi

Authors : Mehtap ALKAN, Mehmet Erhan GÖRE, Harun BAYRAKTAR, Göksel ÖZER

Pages : 250-259

Doi:10.24180/ijaws.537423

View : 35 | Download : 16

Publication Date : 2019-12-13

Article Type : Research Paper

Abstract :Bu çalışmada, kışlık buğdaylarda kök ve kökboğazı çürüklüğüne sebep olan farklı Fusarium türlerine ait izolatlar arasındaki genetik çeşitlik, retrotranspozon temelli olan primerler arası bağlanma bölgesi insert ignore into journalissuearticles values(iPBS); markörleri kullanılarak incelenmiştir. Bu amaçla, 2017 ve 2018 yıllarında Türkiye ve Azerbaycan buğday yetiştirme alanlarından 32 Fusarium türü izolat elde edilmiştir.  İzolatlar arasında en yaygın bulunan tür 23 izolat ile F. culmorum olarak belirlenmiş, bunu beş izolat ile F. pseudograminearum ve dört izolat ile F. graminearum takip etmiştir. Yedi iPBS retrotranspozon markörü izolatlar için 99 adeti polimorfik insert ignore into journalissuearticles values(%86.8); olmak üzere 114 bant üretmiş, primer başına ortalama 14.14 polimorfik bant elde edilmiştir. Markörlerin polimorfik bilgi içeriği insert ignore into journalissuearticles values(PIC); ortalama 0.17 olup, bu değer 0.10 ile 0.29 arasında değişmiştir. iPBS markörleri ile elde edilen verilere dayalı ağırlıklı olmayan aritmetik ortalama eş grup metodu insert ignore into journalissuearticles values(UPGMA); küme analizlerinin sonrasında elde edilen dendrogramda, izolatlar tür seviyesinde ile üç gruba ayrılmıştır. Ayrıca grup içerisinde yer alan izolatlar ise orijini olan ülkeye göre dağılım sergilemiştir. Popülasyon yapısı, Bayesian modellemesine dayanılarak hesaplanmış ve sonuçlar dendrogramdaki izolatların kümelenmesini destekleyecek şekilde üç popülasyona ayrılmış insert ignore into journalissuearticles values( K = 3); ve Ln olasılığının en yüksek ortalama değeri insert ignore into journalissuearticles values(-476.0); eşlik etmiştir. iPBS markörlerinin kullanılması, türler arası seviyede oldukça yüksek düzeyde polimorfizm üretmiş olup türlerin birbirinden ayrılmasını sağlamıştır. Çalışma, buğdaydan elde edilmiş Fusarium spp. izolatlarının genetik çeşitliliğini ve popülasyon yapısını iPBS markörleri analizi ile ortaya koyan ilk çalışma olma özelliği taşımaktadır. 
Keywords : Buğday, Fusarium spp, iPBS markörleri, Retrotranspozon