Genetic variability of Grapevine Leafroll-Associated Virus-1,2,3,4 Infecting Vineyards in Tokat Province of Turkey

Authors : Kübra SARITAŞ, Şerife TOPKAYA

Pages : 438-446

Doi:10.24180/ijaws.977439

View : 21 | Download : 17

Publication Date : 2021-12-30

Article Type : Research Paper

Abstract :Asma yaprak kıvırcıklığı hastalığı insert ignore into journalissuearticles values(GLRD);, dünya çapında asmanın en önemli viral hastalıklarından biridir. Bu çalışma, Grapevine leafroll associated virus -1 insert ignore into journalissuearticles values(GLRaV-1);, Grapevine leafroll associated virus -2 insert ignore into journalissuearticles values(GLRaV-2);, Grapevine leafroll associated virus -3 insert ignore into journalissuearticles values(GLRaV-3);, Grapevine leafroll-associated virus 4 insert ignore into journalissuearticles values(GLRaV-4);, ve Grapevine leafroll-associated virus-9 insert ignore into journalissuearticles values(GLRaV-9); etmenlerinin yaygınlığının araştırılması amacıyla yapılmıştır. Bunun için Tokat ili Merkez, Erbaa, Niksar ve Pazar ilçelerindeki farklı bağ alanlarından virüs benzeri belirti gösteren asmalardan yaprak örnekleri ve bir yıllık bitki sürgünleri toplanmıştır. Surveyde elde edilen toplam 197 örnek GLRaV-1, GLRaV-2, GLRaV-3, GLRaV-4); ve GLRaV-9 etmenlerine özgü primerler ile iki aşamalı polimeraz zincir reaksiyonu insert ignore into journalissuearticles values(PCR); kullanılarak moleküler olarak test edilmiştir. 197 örnekten 106`sı insert ignore into journalissuearticles values(%53.80); bu virüslerle tekli veya çoklu enfeksiyon tespit edilmiştir. 103 insert ignore into journalissuearticles values(%52,28); örnek GLRaV-1 ile pozitif sonuçlanırken, enfeksiyon oranları 10 örnekle GLRaV-3 için %5,18, GLRaV-4 için 5 örnekle %2,53, GLRaV-2 ve GLRaV-9 için %1,03 olarak belirlenmiştir. GLRaV-1, GLRaV-2 ve GLRaV-3`ün pozitif PCR ürünleri çift yönlü sekans analizinden sonra MEGAX ile GenBank`taki referans diğer izolatlarla karşılaştırılması yapılmıştır. GLRaV-1 izolatlarının sekans analizine göre GenBank`taki referans izolatlarla %94-96, GLRaV-2 izolatları %96-99 ve GLRaV-3`ün UO3-3 izolatı %99-100 nükleotid benzerliği göstermiştir.
Keywords : Vitis vinifera, virus, RT PCR, Tokat, Asma yaprak kıvırcıklığı hastalığı