Prokaryotic Diversity of a Hypersaline Spring Water in Pülümür (Tunceli)

Authors : Seval ÇINAR, Mehmet Burçin MUTLU

Pages : 127-134

View : 15 | Download : 8

Publication Date : 2020-12-30

Article Type : Research Paper

Abstract :Tuz göllerinin ve solar tuzlaların mikrobiyal çeşitliliği kapsamlı bir şekilde çalışılmıştır, ancak hipersalin kaynak sularının mikrobiyotaları hakkında sadece birkaç rapor vardır. Bu çalışmada, Pülümür`deki bir hipersalin kaynak suyunda yaşayan arkeal ve bakteriyal gruplara odaklandık. Kültür-bağımlı çalışmalara ek olarak, 16S rRNA genlerinin PCR ile amplifiye edilmiş fragmentlerinin denatüre edici gradiyent jel elektroforezi insert ignore into journalissuearticles values(DGGE); ve floresan in situ hibridizasyon insert ignore into journalissuearticles values(FISH); analizi gerçekleştirildi. DAPI boyası kullanılarak gerçekleştirilen toplam hücre sayımında kaynak suyunda ~105 hücre/mL saptandı. FISH analizi, bakteri hücrelerinin toplam mikrobiyal topluluğun ~%72`sini oluşturduğunu, arkeal hücrelerin ise topluluğun küçük bir bölümünü oluşturduğunu göstermiştir. İzolatlar, Rhodovibrio, Spiribacter, Salinivibrio, Halomonas, Idiomarina, Marinobacter, Natrinema ve Halohasta cinsleriyle filogenetik olarak ilişkiliydi. Spiribacter filotipleri ve Owenweeksia ile uzaktan ilişkili filotipler DGGE analizinden elde edilmiştir.
Keywords : Hipersalin çevreler, Halofilik mikroorganizmalar, DGGE, FISH