Alzheimer Hastalığı Tedavisinde Etkili Cyclo(Phe-Phe) Dipeptidinin Konformasyon Analizi

Authors : Sefa ÇELİK, Sevim AKYÜZ, Ayşen ÖZEL

Pages : 135-142

Doi:10.53433/yyufbed.941445

View : 16 | Download : 10

Publication Date : 2021-12-31

Article Type : Research Paper

Abstract :Cycloinsert ignore into journalissuearticles values(Phe-Phe); dipeptidi Alzheimer hastalığı tedavisinde etkili bir dipeptitdir. Bu çalışmada Cycloinsert ignore into journalissuearticles values(Phe-Phe); dipeptidinin 3-Boyutlu yapısı teorik konformasyon analizi insert ignore into journalissuearticles values(TKA); metodu ile belirlenmiştir. Konformasyon analizinde, Ramachandran haritalarından yararlanılarak ve yan-zincir dihedral açıları insert ignore into journalissuearticles values(χ); yardımıyla tüm olası konformasyonlar belirlenmiştir. Bu haritalar kullanılarak programa girilen başlangıç dihedral açılarla, konformasyon analizi sonunda hesaplanan dihedral açılar karşılaştırmalı olarak verilerek tablolaştırılmıştır. Hesaplama sonucunda dipeptidin en kararlı beş konformasyonunun toplam enerjileri ve toplam enerjilerine katkı sağlayan van der Waals, elektrostatik, hidrojen bağ ve torsiyon enerjileri ayrı ayrı hesaplanmıştır. Ek olarak, en minimum enerjili konformasyon Gaussian03 programı ile DFT metodu kullanılarak optimize edilmiştir. Belirlenen optimize geometri ile konformasyon analizi sonrasında elde edilen geometri karşılaştırılmıştır.
Keywords : Cyclo Phe Phe, Dipeptit, Konformasyon Analizi, Moleküler Modelleme