Assessment of Genetic Diversity in Safflower (Carthamus tinctorius L.) Using RAPD Markers

Authors : Refiye Refika AKÇALI GIACHINO, Duygu İNAN

Pages : 300-308

Doi:10.29133/yyutbd.560936

View : 14 | Download : 8

Publication Date : 2019-06-28

Article Type : Research Paper

Abstract :Çalışmada, Ege Tarımsal Araştırma Enstitüsü Müdürlüğü’nden temin edilmiş olan 4 yerel çeşit insert ignore into journalissuearticles values(TR 49119, TR 42630, TR 42670 ve TR 64702); ve üç adet tescilli aspir çeşidi insert ignore into journalissuearticles values(Yenice 5-38, Remzibey 05 ve Dinçer 5-118); materyal olarak kullanılmıştır. Aspir çeşitleri, RAPD markörleri kullanılarak moleküler düzeyde analiz edilmiştir. Kullanılan on adet RAPD primerinin polimorfik bant oranı % 33.3 insert ignore into journalissuearticles values(OPK-11); ile % 80 insert ignore into journalissuearticles values(OPS-04); arasında değişim göstermiştir. Ortalama polimorfik bant oranı % 63.9 olarak belirlenmiştir. RAPD primerlerinin polimorfik bilgi içeriği insert ignore into journalissuearticles values(PIC); değerleri incelendiğinde, 0.24 insert ignore into journalissuearticles values(OPC-03); ile 0.46 insert ignore into journalissuearticles values(OPA-19); arasında değişim gösterdiği gözlenmiştir. Ortalama PIC değeri 0.38 olarak bulunmuştur. Ortalama çözümleme gücü değeri 3.37, etkili multipleks oran değeri 4.14 ve markör endeks değeri ise 1.57 olarak belirlenmiştir. NTSYS-pc 2.20j istatistik paket programında Jaccard’ın benzerlik katsayısına göre genotipler arasındaki genetik uzaklık değerleri elde edilmiştir. Aspir genotiplerine ait genetik benzerlik değerleri 0.61 ile 0.85 arasında değişim göstermiştir. Ortalama benzerlik oranı 0.69 olarak  bulunmuştur. Aspir çeşitleri UPGMA gruplandırmasına göre iki gruba ayrılmışlardır. Küçük bir nüansla yerli ve tescilli çeşitler ayrı gruplarda yer almıştır. TR 64702 yerel çeşidi ile Remzibey 05 tescilli çeşidi 0.85 değeriyle genetik olarak en benzer genotipler olarak gözlenmiştir.
Keywords : Aspir, Carthamus tinctorius L, Genetik markörler, RAPD, Dendrogram, UPGMA