MOLECULAR DOCKING STUDIES ON SOME BENZAMIDE DERIVATIVES AS TOPOISOMERASE INHIBITORS

Authors : Serap YİLMAZ, Sanaz ATAEİ, İlkay YILDIZ

Pages : 470-480

Doi:10.33483/jfpau.789537

View : 27 | Download : 19

Publication Date : 2020-09-30

Article Type : Research Paper

Abstract :Amaç: Antikanser aktivite göstereceği düşünülen Bazı benzamid türevlerinin insan Topo I ve IIα enzimleri ile moleküler düzeydeki etkileşimlerinin incelenmesi amacıyla bu enzimler üzerinden doking çalışmaları gerçekleştirilmiştir. Gereç ve Yöntem: Doking çalışmalarının gerçekleştirilmesinde protein veri bankasından Topo I için (1K4T) ve Topo IIα için (5GWK) seçilmiştir, Discovery studio 3.5 programı kullanılarak CDocker yöntemiyle doking işlemi yapılmış ve benzamid türevlerinin enzimlere bağlanma enerjileri hesaplanmış ve moleküler etkileşimleri ortaya çıkartılmıştır. Sonuç ve Tartışma: Topo I ve IIα üzerinden yapılan docking işlemi sonucunda benzamid türevi bileşiklerin Topo IIα enzimine afinitesinin daha yüksek olduğu bulunmuştur. 4N6, 5N5 bileşikleri Topo I; 5N3, 5N7 bileşikleri de Topo IIα inhbitörleri olarak antikanser aktivite göstermesi açısından umut verici bileşikler olarak belirlenmiştir.
Keywords : Antikanser, Benzamid, Doking, Topoizomeraz I, Topoizomeraz IIα