EVALUATION OF ZERUMBONE AS AN EGFR TYROSINE KINASE INHIBITOR BY MOLECULAR DOCKING METHOD

Authors : Dilek YONAR, Burcu BABA, Arzu KARAYEL
Pages : 196-207
Doi:10.33483/jfpau.1172166
View : 61 | Download : 14
Publication Date : 2023-01-20
Article Type : Research Paper
Abstract :Amaç: EGFR-TK bölgesi, başta akciğer kanseri olmak üzere çeşitli kanser türlerinin başlaması ve ilerlemesinde büyük önem taşımaktadır. Mevcut EGFR-TK inhibitörlerinin çeşitli yan etkilerinin varlığı, onların uygun kanser terapötikleri olarak kullanılmalarını sınırlandırmaktadır. Bu çalışmada, moleküler yerleştirme yaklaşımı ile EGFR\`yi hedef alan bir antikanser ajan olarak zerumbonun aktivitesini analiz etmeyi ve aktivitesini kurkumin ile karşılaştırmalı olarak değerlendirmeyi amaçladık. Gereç ve Yöntem: EGFR\`nin zerumbon ve kurkumin ile bağlanmasını etkileyen elektrostatik etkileşimleri değerlendirmek için B3LYP/6-31Ginsert ignore into journalissuearticles values(D,P); seviyesinde MEP ve HOMO-LUMO analizleri yapıldı. Bağlanma enerjileri moleküler yerleştirme ile belirlendi ve referans ligand olarak erlotinib ile karşılaştırıldı. Sonuç ve Tartışma: Yerleştirme çalışmaları, erlotinib insert ignore into journalissuearticles values(-7.3 kcal/mol); ile karşılaştırıldığında, sırasıyla -8.0 ve -7.6 kcal/mol bağlanma enerjileriyle kurkumin ve zerumbon için daha yüksek bağlanmalar insert ignore into journalissuearticles values(düşük bağlanma enerjisi); gösterdi. Ancak aralarında önemli bir fark gözlenmedi. Zerumbonun ΔE enerji aralığı 5.09 eV olarak bulundu. Bu sonuç, bu bileşiğin kurkumin insert ignore into journalissuearticles values(ΔE=3.68 eV); ve erlotinib ile karşılaştırıldığında insert ignore into journalissuearticles values(ΔE=4.29 eV); daha fazla kararlılığa sahip olduğu anlamına gelmektedir. Ayrıca, zerumbon EGFR ile güçlü hidrojen bağı etkileşimleri gösterdi ve bu da onun hem kurkumin hem de erlotinib\`deki gibi EGFR inhibitörü olarak potansiyeli olduğunu göstermiştir. Zerumbonun EGFR-TK\`ye karşı inhibitör aktiviteye sahip olabileceği sonucuna varıldı.
Keywords : Akciğer kanseri, epidermal büyüme faktörü reseptörü, kurkumin, moleküler yerleştirme, zerumbon

ORIGINAL ARTICLE URL