KÜÇÜK HÜCRELİ VE KÜÇÜK HÜCRELİ OLMAYAN AKCİĞER KANSERLERİNDE ROL OYNAYAN MİRNA’LARIN BİYOİNFORMATİK ANALİZLERLE KARŞILAŞTIRILMASI

Authors : Yalda Hekmatshoar, Aynur Karadağ Gürel, Adem Aydoğan

Pages : 284-300

Doi:10.33483/jfpau.1529091

View : 112 | Download : 138

Publication Date : 2025-05-19

Article Type : Research Paper

Abstract :Amaç: Akciğer kanseri, dünya çapında karsinomla ilişkili ölümlerin önemli bir nedenidir. Küçük hücreli ve küçük hücreli olmayan 2 ana akciğer kanseri türü bulunmaktadır. İyi prognozun elde edilmesi, hedefe yönelik tedavinin geliştirilmesi ve potansiyel biyobelirteçleri belirlenmesi amacıyla yeni yöntemler bulmak, akciğer kanserinin klinik etkinliğini geliştirilmesi için büyük önem taşımaktadır. Çalışmanın amacı 2 alt tipte farklı ifade olan miRNA’ları bularak patogenezi ve potansiyel moleküler belirteçlerini incelemektir. Gereç ve Yöntem: miRNA verisi içeren GSE19945 ve GSE135918 nolu veri seti GEO veri tabanından indirilmiştir. GEO2R çevrimiçi analiz aracı ile P<0.05 ve log kat değişimi |(FC)|≥ 1 alınarak analiz edilmiştir. Farklı ifade edilen miRNA’ların hedef genleri tanımlanmıştır. Cytoscape PPI kullanılarak ağ görselleştirme ve modül tanımlaması yapılmıştır. miRNA hedef genlerinden 3 adet seçilerek genlerin validasyonu akciğer kanseri hücre hattı A549\\\'da yapılmıştır. Sonuç ve Tartışma: 17 ifadesi azalan ve 2 ifadesi artan ortak miRNA’lar arasında hsa-miR-1249, hsa-miR-326, hsa-let-7c, hsa-miR-199a-5p, hsa-miR-940, hsa-miR-139-3p, hsa-miR-142-3p, hsa-miR-142-5p, hsa-miR-455-5p, hsa-miR-146b-5p,hsa-miR-152hsa-miR-133b, hsa-miR-498, hsa-miR-199b-5p, hsa-miR-140-3p, hsa-miR-203 ve hsa-miR-139-5p yer almaktadır. miRNA’ların moleküler fonksiyonlarının ve sinyal yollarının tanımlanması, 2 kanser tipinin moleküler mekanizmalarının mevcut anlayışını derinleştirebilir ve, tedavi seçeneklerinin geliştirilmesine katkıda bulunabilir.
Keywords : Akciğer kanseri, biyoinformatik analiz, küçük hücreli akciğer kanseri, küçük hücreli olmayan akciğer kanseri, miRNA

ORIGINAL ARTICLE URL