LMP-1 ve Nazofaringial Karsinoma

Authors : Anggun İndah BUDİNİNGRUM, Achmad ROFİ`İ, Suharjono SUHARJONO, Fatchiyah FATCHİYAH

Pages : 480-487

Doi:10.17826/cutf.53492

View : 19 | Download : 11

Publication Date : 2014-07-22

Article Type : Research Paper

Abstract :Amaç: Bu çalışmanın amacı nazofaringial karsinomun litik fazı üzerine etkili olduğu düşünülen LMP-1, ile H2O2 , nitrozamin ve nikotinin gibi dış faktörler arasındaki etkileşimi belirlemektir. Materyal ve Metod: insan LMP-1 insert ignore into journalissuearticles values(GI: 343177335); aminoasid sekansı ile nikotin insert ignore into journalissuearticles values(ID: 89594);, nitrozamin insert ignore into journalissuearticles values(ID: 37183); ve H2O2 insert ignore into journalissuearticles values(ID: 37183); nin yapısal içeriği The National center of Biotechnology Information`a ait veri tabanına göre açıklanmıştır. LMP-1 in 3 boyutlu yapısı SWISS-MODEL web ağı kullanarak tasarlandı. Hex 6,12 hedef moleküle öncülük etmesi için kullanıldı. LigPlus+1.4.4 software ile ligand detayları tarandı. Moleküler grafikler ve analizler PyMOL ile yapıldı. Bulgular: LMP-1 in H2O2 , nitrozamin ve nikotin ile etkileşimi vardır. LMP-1 in H2O2 etkileşimi için harcadığı enerji insert ignore into journalissuearticles values(-67,79 kj/mol);, nikotin insert ignore into journalissuearticles values(-149,43 kj/mol); ve nitrozamin insert ignore into journalissuearticles values(-82,93 kj/mol); için kullanılandan daha düşüktür. LMP-1 ile H2O2 arasındaki etkileşimin türü Hidrojen bağı iken LMP-1 ile nitrozamin ve nikotin arasındaki etkileşim hidrofobik bağdır. Sonuç: LMP-1 H2O2 ile nitrozamin ve nikotine göre daha güçlü bağ kurar. Dış etken olan H2O2 nin LMP-1 i etkileyerek NPC li hastalarda litik enfeksiyon fazına geçişe neden olduğu tahmin edilmektedir.
Keywords : H2O2, LMP 1, nazofaringial karsinom, nikotin, nitrozamin