Doğal Fermente Olan Sütteki Lactobacillus Spp.16S rRNA Geninin Kısmi Analizi

Authors : Nur KUSMİYATİ, Nur HİDAYAT, Fatchiyah FATCHİYAH

Pages : 99-104

Doi:10.17826/cutf.82552

View : 19 | Download : 6

Publication Date : 2014-07-22

Article Type : Research Paper

Abstract :Amaç: Bu çalışmanın amacı doğal olarak fermente olan sütten Lactobacillus spp. türüne ait 16S rRNA ların gen sekansı yapmaktır. Materyal ve Metod: Kullanılan metodlar; alkali lizis yöntemiyle total DNA izolasyonu, spesifik primerlerle PCR amplifikasyonu ve amplifiye edilmiş DNA ların sekans analizlerinin yapılması şeklindedir. Elde edilen PCR ürünleri yaklaşık 585 bp uzunluğunda olup V1-V3 değişken bölgelerini içermektedir. Sekanslanan 16s rRNA daha sonra gen bankasıyla karşılaştırıldı. Bulgular: 16s rRNA geninin korunmuş bölgeleri; 189-358 ve 384-445 sırasıyla %95,9 ile %94,9 oranında korunurken, 16s rRNA geni totalde %78.8 oranında korunmuştur. Doğal sütün fermentasyonundan izole edilen bu 7 izolattan 2 tanesi L.Plantaruminsert ignore into journalissuearticles values(benzerlik oranları %98.28 ve %97.78 diğer 5 izolattan 2`si L. Rhamnosus insert ignore into journalissuearticles values(benzerlik oranları insert ignore into journalissuearticles values(98.38 ve %97.51);, diğer 2`si L. zeae insert ignore into journalissuearticles values(benzerlik oranları %97.36 ve % ve %98.38);, biri ise L. case insert ignore into journalissuearticles values(benzerlik oranı%98.20); şeklinde tanımlanmıştır. Sonuç: Çalışmanın sonuçları test edilen izolatın Laktobailus genusuna ait olduğunu, fakat farklı türde sınıflandırıldığını göstermiştir.
Keywords : laktobacillus, doğal fermente süt, 16s rRNA, parsiyal analiz