Molecular epidemiological typing of M. tuberculosis isolates isolated from Turkey`s Eastern Anatolia with in house PCR method

Authors : Elif AYDIN, Gülnur TARHAN, Funda ŞAHİN, Sami EREN

Pages : 191-198

Doi:10.17826/cumj.997873

View : 20 | Download : 10

Publication Date : 2022-03-31

Article Type : Research Paper

Abstract :Amaç: Örneklerin mikroskopi ve kültür sonuçlarının karşılaştırılması, izolatların ilaç direnç oranlarının belirlenmesi, suşlar arasındaki epidemiyolojik ilişkilerin ERIC-PCR, RAPD-PCR, OUT-PCR ile ev içi PCR tekniğine dayalı olarak değerlendirilmesi amaçlandı. Gereç ve Yöntem: 2010 numunenin direkt mikroskopi ve kültür sonuçları analiz edildi. İlaç duyarlılık sonuçları TULSA`dan elde edildi. İzolatların tiplendirilmesi, bir devlet üniversitesinin tıp fakültesinin mikrobiyoloji laboratuvarında, in house PCR yöntemi ile gerçekleştirilmiştir. Bulgular: Pozitif örneklerin %2.68`inde Aside dirençli basil insert ignore into journalissuearticles values(ARB); pozitif + kültür pozitifliği, yaymada %2.93`ünde ARB pozitif ve kültür negatif, yaymada %1.34`ünde ARB negatif ve kültür pozitifliği vardı. Kültür pozitif olan 33 izolatta primer antitüberküloz insert ignore into journalissuearticles values(anti-TB); ilaçlara direnç görülmezken, bir veya daha fazla primer anti-TB ilaca direnç %9.09`da gözlendi. Tek ilaç direnci %3.03, Isoniazid insert ignore into journalissuearticles values(INH); ve INH kritik ilaçlara direnç %6.06 idi. İzolatlar ERIC-PCR ile 3 gruba, OUT-PCR için 5 grup ve RAPD-PCR ile 6 gruba ayrıldı. Sonuç: Çalışılan numune oranının düşük olması, tedavi sürecinde alınan numunelerin negatif olması nedeniyle pozitiflik oranları düşüktü. ERIC-PCR, RAPD-PCR ve OUT-PCR gibi moleküler teknikler, kökenler arasındaki farklılıkları, benzerlikleri değerlendirmede Mycobacterium tuberculosis`in insert ignore into journalissuearticles values(MTB); epidemiyolojik tiplendirilmesi için kolay, hızlı ve ucuz yöntemlerdir.
Keywords : Mycobacterium tuberculosis, EZN, ERIC PCR, RAPD PCR, OUT PCR