Determination of acidic dissociation constants of L-phenylalanyl-glycine and L-alanyl-L-alanine in water using ab initio methods

Authors : Farhoush KİANİ, Mahmoud TAJBAKHSH, Fereydoon ASHRAFİ, Nesa SHAFİEİ, Azar BAHADORİ, Fardad KOOHYAR

Pages : 263-274

View : 24 | Download : 11

Publication Date : 2014-06-01

Article Type : Research Paper

Abstract :A sidik ayrışma sabiti organik bileşiklerin en temel özelliklerinden birisidir. Bu çalışmada, yoğunluk fonksiyon teori DFT hesaplamaları 6-31+G d ile B3LYP birleştirilmiş temel setler L-fenilalanil-glisin ve L-alanil-Lalaninin asidik ayrışma sabitlerinin belirlenmesinde uygulanmıştır. L-fenilalanil-glisin ve L-alanil-L-alaninin sulufaz pK değeri hesaplamaları için ab initio yöntemi sunulmuştur. Mevcut türler ve su arasında oluşan moleküller arası hidrojen bağlarının oluşumu Tomasi yöntemi kullanılarak analiz edilmiştir. Bu şekilde, su molekülleri ile solvate olmuş L-fenilalanil-glisin ve L-alanil-L-alaninin katyonu, anyon ve nötr türleri bazik sulu çözeltilerde belirlenmiştir. Ayrıca, bu dipeptidlerin pKa değerleri arasındaki ilişki teorik olarak incelenmiş ve kıyaslanabilir uyumlu deneysel sonuçlar bulunmuştur
Keywords : Asitlik sabiti, L fenilalanil glisin, L alanil L alanin, çözünme serbest enerjisi, ab initio yöntemleri