Study on Thermophysical Properties of Arginine and Glutamic Acid in Water Using Ab Initio Methods

Authors : Farhoush KİANİ, Azam YOUSEFİ, Fardad KOOHYAR

Pages : 17-32

View : 16 | Download : 9

Publication Date : 2015-03-01

Article Type : Research Paper

Abstract :G ibbs serbest enerji ve asidik ayrışma sabiti, moleküllerin iki önemli termodinamik özellliğidir. Ab initio’nun yoğunluk fonksiyonel teori DFT ile kombinasyonu ve Tomasi’nin polarize olmuş sürekli dizi modelinden PCM yararlanılarak sudaki arjinin ve glutamik asitin asidik ayrışma sabitleri hesaplanmıştır. pK değerinin teorik tahmini için B3LYP/6-31+G d teori seviyesi uygulaması kullanılmıştır. Ayrıca elektronik yapı teorisiyle geleneksel DFT yöntemi bu moleküllerin moleküler konformasyonları ve çözünen-çözücü etkileşimleri incelenmiştir. Elde edilen bulgulara gore alkali sulu çözeltilerde arjinin ve glutamik asitin katyon, anyon ve nötral türleri, sırasıyla, bir, iki, üç ve dört su molekülü ile çözünmüştür. Varolan türler ile su molekülleri arasında molekül içi hidrojen bağları vardır. Tepkime mekanizmasını analiz etmek için atomik değişimler araştırılmıştır. Bu çalışmada, deneysel pK değerleri ile teorik pK değerleri arasında iyi bir ilişki olduğu görülmektedir
Keywords : Arjinin, Glutamik asit, DFT yöntemi, Asidik ayrışma sabiti