Serapias orientalis’in mikorizal fungus çeşitliliği

Authors : Vildan Akın Mutlu, Hamdiye Şehirli, Yasemin Özdener Kömpe

Pages : 301-309

Doi:10.17474/artvinofd.701282

View : 281 | Download : 2884

Publication Date : 2020-09-15

Article Type : Research Paper

Abstract :Orkideler, yumrularının aşırı toplanması ve habitatlarının ciddi şekilde tahrip olması sonucu yok olma tehdidi altındadır. Doğada orkidelerin korunması mikorizal fungus biyolojik çeşitliliğinin varlığına bağlıdır. Bu çalışmada, Orta ve Doğu Karadeniz bölgesinde 4 ilin (Samsun, Ordu, Giresun, Trabzon) sınırları içinde farklı habitatlardan toplanan Serapias orieantalis (Greuter ) Bauman H, Künkele köklerindeki mikorizal fungusların moleküler tanımlaması yapılmıştır. Bitki kökleri 2015 bahar aylarında toplanmış ve önce mikroskopta incelenerek mikorizal funguslar izole edilmiştir. Saflaştırılan izolatlar, koloni özellikleri (koloni tipi, koloni rengi), hif yapısı (hif çapı ve dallanma yapısı) ve çekirdek sayılarının belirlenmesi amacıyla PDA (patates dektroz agar) ortamında geliştirilmiştir. İzolatları morfolojik özelliklerine göre gruplandırmak için küme analizi (UPGMA) yöntemi uygulanmış ve kladogram oluşturulmuştur. Kümeleme analizine göre oluşturulan 3 grubun izolatlarını moleküler düzeyde tanımlayabilmek için ITS-1 ve ITS-4 primerleri kullanılarak nüklear ribozomal DNA (rDNA)’nın ITS1-5.8S-ITS2 gen bölgesi çoğaltılmıştır. DNA dizilimine dayanarak, 13 Rhizoctonia benzeri izolatın Tulasnella cinsi ile 2 Rhizoctonia benzeri olmayan izolatın Fusarium oxysporum Schltdl. türü ile yakın ilişkili olduğu bulunmuştur.
Keywords : Serapias orientalis, mikoriza, fungus, çeşitlilik, ITS

ORIGINAL ARTICLE URL