Investigation of the Prevalence of vanA and vanB genes in vancomycin resistant enterococcus (VRE) by Taq Man real time PCR Assay

Authors : Bahman Mirzaei, Taghi Naserpoor Farivar, Puran Juhari, Masoome Aslani Mehr, Reyhane Babaei

Pages : 192-198

Doi:10.5799/ahinjs.02.2013.04.0107

View : 8 | Download : 3

Publication Date : 2013-12-01

Article Type : Research Paper

Abstract :Amaç: Enterokoklar önemli hastane enfeksiyonu etkenidirler ve antimikrobiyal direnç potansiyelleri nedeniyle rezistans genlerinin yayılmasında önemli rolleri bulunmaktadır. Günümüzde bu mikroorganizmalar önemli bir halk sağlığı sorunu olarak tanımlanmıştır. Bu çalışmada İran’daki bazı hastanelerde değişik klinik örneklerden izole edilen vankomisin dirençli enterokok insert ignore into journalissuearticles values(VRE);’lar arasında vanA ve vanB genlerinin sıklığının araştırılması amaçlandı. Yöntemler: Suşların vankomisin duyarlılıkları E test yöntemiyle araştırılarak minimum inhibitör konsantrasyon insert ignore into journalissuearticles values(MİK); değerleri belirlendi. Vankomisin dirençli ve vankomisine orta düzeyde dirençli Enterococcus faecalis ve Enterococcus faecium suşlarında Taq Man real time PCR assay ile vankomisin direncini kodlayan vanA ve vanB genleri hedeflendi. Bulgular: Çalışma süresince klinik örneklerden toplam 235 enterokok suşu izole edildi. Bu şuşlardan 193’ü insert ignore into journalissuearticles values(% 82,1); E. faecalis, 33’ü insert ignore into journalissuearticles values(% 14,0); E. faecium, 1’i insert ignore into journalissuearticles values(% 0,4); Enterococcus avium, 1’i insert ignore into journalissuearticles values(% 0,4); Enterococcus raffinosus ve 7’si insert ignore into journalissuearticles values(% 3,0); Enterococcus galinarium olarak tanımlandı. Toplam 235 enterokok suşunda 32’si insert ignore into journalissuearticles values(% 13,6); VRE idi. Toplam 235 suştan 18 insert ignore into journalissuearticles values(% 7,7);’i E. faecalis ve 14’ü insert ignore into journalissuearticles values(% 6,0); E. faecium idi. Bu suşların 27 insert ignore into journalissuearticles values(% 84,4);’sinde vanA ve vanB genleri belirlendi insert ignore into journalissuearticles values(bazı izolatlar hem vanA ve hem vanB genlerine sahip idi);. Suşların 5’inde insert ignore into journalissuearticles values(% 15,6); direnç geni belirlenemedi.Sonuçlar: Araştırmamızda klinik VRE suşları arasında E. faecalis suşlarının sıklıkta olduğu ve vanA geninin vankomisin direncine sebep olan en sık gen olduğu gözlendi. Bu çalışma Taq Man real time PCR assay testinin vankomisin direnç genlerinin gösterilmesinde kullanılabilen, kesin ve hızlı bir test olduğunu göstermektedir
Keywords : VRE, Taq Man real time PCR, vanA, vanB, Enterococcus faecalis, Enterococcus faecium