An investigation of type 3 secretion toxins encoding-genes of Pseudomonas aeruginosa isolates in a University Hospital in Egypt

Authors : Awny A Gawish, Nahla A Mohamed, Gehan A ElShennawy, Heba A Mohamed

Pages : 116-122

Doi:10.5799/ahinjs.02.2013.03.0093

View : 6 | Download : 6

Publication Date : 2013-09-01

Article Type : Research Paper

Abstract :Amaç: Pseudomonas aeruginosa tip 3 sekresyon sistemiyle insert ignore into journalissuearticles values(T3SS ); direk dokuya salınan 4 sekretuar toksin kullanır. Bu çalışmanın amacı hastane enfeksiyonlarından ve çevresel kaynaklardan izole edilen P. aeruginosa izolatlarında sekretuar toksin kodlayan üç genin prevalansını saptamaktır. Yöntemler: Çalışılan P. aeruginosa izolatlarının klonal yakınlığı RAPD tiplendirme metodu ile bakılmıştır. Sekretuar toksin kodlayan genleri saptamak için 85 P. aeruginosa izolatında insert ignore into journalissuearticles values(farklı klinik ve bölümlerde yatan hastalardan izole edilen 68 hastane kaynaklı izolatı ve ikisi yoğun bakım ünitesindeki sağlık çalışanının ellerinden izole edilen 17 çevresel izolat); multiplex PCR çalışıldı. Bulgular: RAPD fingerprint analizi ile varlığı tespit edilen 54 RAPD paterninin varlığı suşların çoğunun uzak genotiplere sahip olduğunu gösterdi. Tüm izolatlarda saptanan genlerin prevalansı sırasıyla exoT insert ignore into journalissuearticles values(% 100);, exoS insert ignore into journalissuearticles values(% 40);, exoY insert ignore into journalissuearticles values(% 83,5); ve exoU insert ignore into journalissuearticles values(% 62,4); şeklindeydi. Farklı enfeksiyon bölgelerinden üretilen izolatlar arasında yada hastane ve çevresel kaynaklardan elde edilen izolatlar arasında bu genlerin prevalansı açısından anlamlı bir fark yoktu. P. aeruginosa suşlarından exoS insert ignore into journalissuearticles values(% 37,6); veya exoU insert ignore into journalissuearticles values(% 60); genlerinden birini taşıyanlar her iki geni taşıyanlardan insert ignore into journalissuearticles values(% 2,4); anlamlı olarak daha fazlaydı insert ignore into journalissuearticles values(p<0.001);. Sonuç: ExoT tüm izolatlarda bulunurken exoS, exoY ve exoU genlerinin varlığı değişkenlik gösteriyordu. ExoU geni exoT ve exoY geninden sonra üçüncü sıklıkta görülmekteydi. exoS, ExoY ve exoU görülme prevalansı hastane kaynaklı ve çevre kaynaklı suşlar arasında veya değişik bölge veya enfeksiyonlar arasında anlamlı bir farklılık göstermedi. ExoS ve exoU genleri hemen tüm izolatlarda ya birlikte bulunmakta veya iki de bulunmamakta idiler
Keywords : Pseudomonas aeruginosa, type 3 sekresyon toksinleri, multiplex PCR