Investigation of the presence of OXA 48 and mcr-1 genes in carbapenem-resistant Acinetobacter baumannii, Klebsiella pneumoniae and Pseudomonas aeruginosa strains by in house-PCR method

Authors : Gülnur TARHAN, Funda ŞAHİN, Salih CESUR

Pages : 118-123

Doi:10.47582/jompac.1028959

View : 64 | Download : 14

Publication Date : 2021-12-21

Article Type : Research Paper

Abstract :Karbapenem dirençli Enterobacteriaceae insert ignore into journalissuearticles values(KRE);’nin neden olduğu enfeksiyonlar, küresel sağlık için ciddi bir sorundur. Karbapenemler, kapsamlı uygulamaları nedeniyle günümüzde direnç mekanizmaları gelişmiştir. Karbapenemaz sentezleyen izolatların saptanması, dağılımlarının takip edilmesi ve uygun tedavinin sağlanabilmesi açısından oldukça önemlidir. Günümüz ilaç direncinin saptanmasında Real-time-polimeraz zincir reaksiyonu insert ignore into journalissuearticles values(RT-PZR);, başta olmak üzere çeşitli ticari moleküler tanı yöntemleri kullanılmaktadır. Ancak testlerin yapılabilmesi için pahalı ekipmanlara ihtiyaç duyulması nedeni ile, rutin bakteriyoloji laboratuvarlarında uygulanabilecek güvenilir, pratik ve düşük maliyetli testlere ihtiyaç duyulmaktadır. Bu çalışma, Etlik İhtisas Eğitim ve Araştırma Hastanesi’nde çeşitli servislerde yatan hastalardan izole edilen genişlemiş spektrumlu beta-laktamaz insert ignore into journalissuearticles values(GSBL); pozitif, karbapenemlere dirençli dirençli, kolistine duyarlı toplam 60 Gram-negatif bakteri insert ignore into journalissuearticles values(39 suş Acinetobacter baumannii insert ignore into journalissuearticles values(A. baumannii);, 11 suş Klebsiella pneumoniae insert ignore into journalissuearticles values(K. pneumoniae ve 10 suş Pseudomonas aeruginosa insert ignore into journalissuearticles values(P. aeruginosa););’de izolatın mcr-1 ve blaOXA-48 gen bölgelerinin varlığını belirlemek amacıyla yapılmıştır. Klinik örnekler konvansiyonel yöntemler ile izole edildikten sonra kesin tanımlama ve antibiyotik duyarlılık testleri otomatize sistemle çalışılmıştır. GSBL ve kolistin direncinin doğrulanması disk difüzyon testi ve gradyen testleri ile yapıldı. PZR sonuçlarına göre A. baumannii suşunun 10 tanesinde, K. pneumoniae suşunun bir tanesinde ve P. aeruginosa suşunun bir tanesinde mcr-1 geni saptandı. A. baumannii suşunun 5 tanesinde, K. pneumoniae suşunun 2 tanesinde blaOXA-48 geni saptandı. A. baumannii suşunun bir tanesinde her iki genin varlığı tespit edilmiştir. Sonuç olarak, karbapenemaz enzimi üretimi ve gen bölgesinin belirlenmesinde hızlı, tekrarlanabilir ve yüksek doğrulukta yeni tanı yöntemlerine ihtiyaç duyulmaktadır.
Keywords : Karbapenemaz direnci, mcr 1, blaOXA 48, kolistin

ORIGINAL ARTICLE URL