Molecular Docking Analysis Of N-[2-(3-Methylthio(1,2,4-Thiadiazol-5-Ylthio))Acetyl] Benzamide Molecule With Integrin And DNA

Authors : A Demet DEMİRAG, Sefa ÇELİK, Doğan ÖZEN, Ayşen ÖZEL, Sevim AKYÜZ

Pages : 19-27

View : 46 | Download : 11

Publication Date : 2021-12-31

Article Type : Research Paper

Abstract :N-[2-insert ignore into journalissuearticles values(3-Metiltiyoinsert ignore into journalissuearticles values(1,2,4-tiyadiazol-5-yltiyo););asetil]benzamid molekülünün insert ignore into journalissuearticles values(C12H11N3O2S3); en kararlı yapısı yarı deneysel AM1 hesaplamaları kullanılarak konformasyon analizi ile belirlenmiştir. Elde edilen en kararlı konformasyon, moleküler kenetlenme analizinde N-[2-insert ignore into journalissuearticles values(3-Metiltiyoinsert ignore into journalissuearticles values(1,2,4-tiyadiazol-5-yltiyo););asetil]benzamid molekülünün başlangıç verisi olarak kullanılmıştır. Bu molekülün DNA ve hedef protein α5β1 integrini ile yapılan moleküler kenetlenme çalışmaları sonucunda bağlanma afiniteleri sırasıyla ΔG = -7.4 ve -7.7 kcal/mol olarak bulunmuştur. Antikanser çalışmalarda önemli rol oynayan hedef protein integrin ve DNA`nın bağlanma bölgeleri ve ligand-integrin ve ligand-DNA komplekslerinin etkileşimleri belirlenmiştir. İncelenen molekülün hedef moleküllerdeki 3D kenetlenmiş yapıları ve ligand reseptör komplekslerinin etkileşime giren grupları hesaplanmış ve şekillerde gösterilmiştir.
Keywords : Benzamid Molekül, Hedef Protein İntegrin, DNA, Antikanser, Moleküler Kenetleme

ORIGINAL ARTICLE URL