Çanakkale İli Ispanak Üretim Alanlarındaki Hıyar Mozaik Virüsü (Cucumber Mosaic Virus CMV) Enfeksiyonunun Belirlenmesi ve Moleküler Karakterizasyonu

Authors : Ali KURTOĞLU, Savaş KORKMAZ

Pages : 43-51

View : 12 | Download : 12

Publication Date : 2018-01-29

Article Type : Research Paper

Abstract :Çanakkale ilinde ıspanak üretimi yapılan alanlarda Hıyar mozaik virüsü insert ignore into journalissuearticles values(Cucumber mosaic virüs; CMV); enfeksiyonunun belirlenmesi ve karakterizasyonu amacı ile 2016−2017 yılları üretim sezonunda arazi çıkışları gerçekleştirilmiştir. Yapılan arazi çıkışlarında virüs ve virüs benzeri simptom gösteren 66 ıspanak örneği toplanmıştır. Toplanan örnekler CMV varlığının belirlenmesi amacıyla DAS-ELISA yöntemi ile test edilmiştir. Testlemeler sonucunda örneklerden dört tanesi CMV ile enfekteli olarak bulunmuştur. Enfekteli bulunan izolatlar arasından bir tanesi rastgele seçilerek moleküler karakterizasyonu gerçekleştirilmiştir. Moleküler karakterizasyon çalışmaları sonucunda Çanakkale CMV ıspanak izolatı dünya CMV izolatları ile nükleotid düzeyinde %87−98 ve aminoasit düzeyinde ise %91−99 oranında benzerlik göstermiştir. Ayrıca gerçekleştirilen filogenetik analizler sonucunda bu izolatın altgrup IA’da yer aldığı belirlenmiştir. 
Keywords : DAS ELISA, RT PCR, benzerlik, filogenetik