Sert Çekirdeklilerde Bakteriyel Kansere Neden Olan Pseudomonas syringae Pathovarlarının Klasik ve Moleküler Yöntemlerle Tanısı

Authors : Damla ERTİMURTAŞ, Hatice ÖZAKTAN

Pages : 55-61

View : 18 | Download : 9

Publication Date : 2020-12-22

Article Type : Research Paper

Abstract :Bakteriyel kanser belirtisi görülen şeftali, badem ve kiraz gibi sert çekirdekli meyve ağaçlarından izole edilmiş ve Ege Üniversitesi Ziraat Fakültesi Bitki Koruma Bölümü Bakteriyoloji laboratuar stoklarına alınmış 15 Pseudomonas syringae insert ignore into journalissuearticles values(Ps); pathovarlarının LOPAT insert ignore into journalissuearticles values(levan oluşumu, oxidase, patateste pektolitik aktivite, arginin dehidrolaz, tütünde aşırı duyarlılık reaksiyonu);, GATTa insert ignore into journalissuearticles values(jelatinin hidrolizi, aesculinin hidrolizi, tyrosin aktivitesi, tartaric acid);, karbon kaynaklarının kullanımı klasik tanı testleri ile tanısı yapılmıştır. Ayrıca patojenisite, in-vitro’da syringomycin üretimi ve buz çekirdeği oluşturma aktivitesi insert ignore into journalissuearticles values(INA); tanı testleri yapılmıştır. Klasik tanı testleri sonucunda kesin tanısı yapılamayan Pseudomonas syringae pathovarı izolatlarının moleküler tanısı yapılmıştır. Pseudomonas syringae pv. syringae insert ignore into journalissuearticles values(Pss);’nin syringomycin sentezinden sorumlu syrB geni ve Pseudomonas syringae pv. morsprunorum insert ignore into journalissuearticles values(Psm);’un coronatine sentezinden sorumlu cfl geni klasik PCR ile belirlenmiştir. Pss ve Psm’nin ayırt edilmesinde 4 housekeeping geni insert ignore into journalissuearticles values(cts, rpoD, gapA, gyrB); sekans analizleri yapılmıştır. Klasik ve moleküler tanı sonucunda 15 Ps pathovarının 9’u Pss olarak kesin tanısı yapılmıştır.
Keywords : tanılama, PCR, Sert çekirdekliler, Pseudomonas syringae, Bakteriyel hastalık