DISTINCTIVE SIRE1 RETROTRANSPOSON PATTERNS ON BARLEY CHROMOSOMES?

Authors : Elif KARLIK, Nermin GOZUKİRMİZİ

Pages : 9-15

Doi:10.23902/trkjnat.773302

View : 21 | Download : 11

Publication Date : 2021-04-15

Article Type : Research Paper

Abstract :SIRE1, Tyl/Copia Uzun Uç Tekrarlı insert ignore into journalissuearticles values(Long Terminal Repeats- LTR); retrotranspozon üst ailesine ait olan aktif, nispeten yüksek kopyalı bir retroementtir. Arpa genomundaki ayırt edici SIRE1 elementlerinin insert ignore into journalissuearticles values(ENV ve GAG); dağılımları floresan in situ hibridizasyonu insert ignore into journalissuearticles values(FISH); kullanılarak gözlemlendi. Tetramethylrhodamine-dUTP insert ignore into journalissuearticles values(TRITC);-işaretli probların elde edilmesinde PCR gerçekleştirildi. SIRE1 ENV ve GAG domainlerinin yerleşimleri, Hordeum vulgare L. cv. Hasat kök preparatlarında konfokal mikroskobu altında gösterildi. Sonuçlarımız, arpa genomundaki SIRE1 elementlerinin ENV ve GAG dağılımlarını göstermektedir. Bu sonuçlar, SIRE1 elementlerinin arpa genomunun organizasyonunun ortaya çıkarılmasına katkı sağlayacaktır. 
Keywords : Fluorescence in situ hybridization, Retrotransposon, SIRE1, Barley, ENV, GAG