WEB BASED PROGRAM FOR BIG MOLECULAR DATA CONVERSION FOR ANALYSIS BY MATLAB, PHYTON OR R

Authors : Halit Hami OZ, Mahmut AYDIN

Pages : 27-31

View : 16 | Download : 15

Publication Date : 2018-07-01

Article Type : Research Paper

Abstract :Moleküler veriler farklı formatlarda oluşturulur: MICROSAT, SNP, AFLP, RFLP, DNA, RNA, MESAFANT, PROTEİN, DART,  INDEL, HIZLI. Dosya biçimleri arasında Arlequin, Genpop, Structure, Nexus, Mega, Fasta bulunur. Bu alandaki bilim  adamları bu moleküler veriyi analiz etmek ve bu büyük veriyi ihtiyaç duyduğu biçime dönüştürmek için özel  programlar yazarak ya da verilerini analiz için bazı merkezlere göndererek yapar. Kullanıcı dostu ve kullanımı kolay  web tabanlı moleküler veri dönüştürme programı, Kafkas Üniversitesi Biyomühendislik ve Bilgisayar Mühendisliği  Bölümü’nde R programlama dili kullanılarak geliştirilmiştir. Kullanıcılar, giriş ve çıkış dosya formatlarını seçen  Web tabanlı programı kullanarak veriler yükleyebilirler ve R programlama dili veya MATLAB Wavelet Toolbox  kullanarak verilerini analiz edebilirler.
Keywords : Matlab, Wavelet, Big Data, R, Bioenformatics