Investigation of Interaction of Bismarck Brown Y- Palladium Complex with AS1411 G-quadruplex Aptamer

Authors : Esra BAĞDA, Rümeysa DURAK, Efkan BAĞDA, Didem DUMAN, Ebubekir AYHAN

Pages : 116-122

Doi:10.51435/turkjac.1203081

View : 20 | Download : 11

Publication Date : 2022-12-29

Article Type : Research Paper

Abstract :Artan metabolik aktivite ve metastaz, kanser hücrelerinin ana ve en bilinen özellikleridir. Hücrelerin artan aktivitesi, G-dörtlü yapıların oluşumunda artışa neden olur. G-quadruplex\`in çeşitli ligandlarla stabilizasyonu veya destabilizasyonu, hücre proliferasyonunda bozulmalara neden olabilir. Dolayısıyla, bu ikincil yapının stabilizasyonu veya destabilizasyonu önemli antikanser ilaç hedefleridir. Bu çalışmada, Bismarck kahverengi Y-Pd kompleksi, kolay, tek aşamalı bir karıştırma yöntemiyle oluşturulmuştur. Kompleksin spektral özellikleri ve stokiyometrisi, Uv-vis spektrofotometrik olarak araştırıldı. 1:2, Bismarck Brown Y-Pd kompleksinin AS1411 G-dörtlü yapı ile etkileşimi spektrofotometrik titrasyon ile araştırıldı. Bağlanma sabitleri hesaplandı ve 4.38 insert ignore into journalissuearticles values(±1.96); x104 M-1 olarak bulundu. Kompleksin G-dörtlü konformasyon üzerindeki etkisi CD spektroskopisi ile araştırıldı. Etkileşimlerin varlığı, yüksek hassasiyetli LED kaynaklı floresan dedektör Qsep100 kapiler jel elektroforez sistemi kullanılarak DNA polimeraz durdurma testi ile desteklenmiştir.
Keywords : G quadruplex DNA, As1411, Bismarck brown Y, Palladium, CD spectroscopy, capillary gel electrophoresis