Ege ve Akdeniz Bölgesindeki Gökkuşağı Alabalıklarından İzole Edilen Flavobacterium psychrophilum Suşlarının Fenotipik Ve Genetik Farklılıklarının Belirlenmesi

Authors : Ahmet Tahir ERSOY, Seçil METİN, Ertan Emek ONUK

Pages : 265-275

Doi:10.22392/egirdir.400641

View : 13 | Download : 11

Publication Date : 2018-12-01

Article Type : Other Papers

Abstract :Bu çalışma ile Akdeniz bölgesinde bulunan 14 farklı gökkuşağı alabalığı insert ignore into journalissuearticles values(Oncorhynchus mykiss Walbaum, 1792); işletmesinde Flavobacterium psychrophilum’un varlığı ile fenotipik ve genotipik özelliklerinin araştırılması hedeflenmiştir. Bu amaçla Kasım 2012-Mart 2013 tarihleri arasında ticari alabalık işletmelerinden sperm, yumurta, gözlenmiş yumurta, keseli larva ve 0.2-5 gr ağırlığındaki larvalardan örnekler alınmıştır. Örneklerden olası F. pyschrophilum’un izolasyonu konvansiyonel mikrobiyolojik metotlar kullanılarak yapılmış ve toplamda 172 adet izolat elde edilmiştir. Elde edilen tüm izolatların enzim aktivitesi API ZYM test sistemine göre tespit edilmiştir. Yapılan fenotipik testler sonucunda F. psychrophilum olduğu düşünülen 65 izolat belirlenmiştir. Bu izolatların moleküler olarak doğrulanmasında F. pyschrophilum spesifik Polimeraz Zincir Reaksiyonu insert ignore into journalissuearticles values(PCR); metodu kullanılmıştır. Hasta balıklardan izole edilen 17 izolatın insert ignore into journalissuearticles values(11 karaciğer, 3 dalak ve 3 böbrek); F. psychrophilum’a özgü 971 bp’lik bant verdiği saptanmıştır. İzolatlar arası klonal ilişkinin belirlenmesi amacıyla RAPD-PCR metodu kullanılmıştır. Bu metoda göre F. psychrophilum izolatlarının beş farklı RAPD bant paterni insert ignore into journalissuearticles values(F1-F5); verdiği saptanmıştır. İzolatların % 85 benzerlik katsayısına göre bir “unique” tip insert ignore into journalissuearticles values(F1 nolu genotip); ve bir küme içerisinde gruplandığı belirlenmiştir. Yapılan antibiyogram testi sonucu, izolatların trimetroprim/sulfametakzol, klindamisine, ampisillin, tekrasiklin, enrofloksasin, kloramfenikole, oksitetrasiklin, florfenikol ve tobramisin’e duyarlı olduğu belirlenmiştir. Sonuç olarak, bu çalışmadan elde edilen bulgular RAPD-PCR`da kullanılan M13 primerinin F. psychrophilum izolatları arasındaki klonal ilişkinin belirlenmesinde kullanılabilir olduğunu göstermiştir
Keywords : Oncorhynchus mykiss, Flavobacterium psychrophilum, identifikasyon, API ZYM, PCR