Boron mine ponds: metagenomic insight to bacterial diversity

Authors : Pınar AYTAR ÇELİK, Mehmet Burçin MUTLU, Ferhan KORKMAZ, Belma NURAL YAMAN, Serap GEDİKLİ, Ahmet ÇABUK

Pages : 229-235

Doi:10.46309/biodicon.2021.902221

View : 17 | Download : 13

Publication Date : 2021-08-15

Article Type : Research Paper

Abstract :Biyolojik potansiyeli olan yeni mikroorganizmaların kaynağı olabileceği için, bor içeriği yüksek ortamlarda bulunan mikroorganizmaların belirlenmesi ekolojik ve biyoteknolojik uygulama potansiyelleri açısından önemlidir. Bu bağlamda, bor madenciliği faaliyetlerinin gerçekleştirildiği çevrelerdeki birikinti suları boronofilik / boronotolerant mikroorganizmalar için önemli habitatlardır. Bu çalışmada, Balıkesir-Bigadiç ve Eskişehir-Kırka Bor Maden İşletmeleri atık madenciliği havuzlarındaki bakteri topluluğu, 16S rDNA gen hedefli Illumina MiSeq dizilimi kullanılarak incelenmiştir. Yüksek verimli dizilerin büyük kısımları Proteobacteria, Planctomycetes, Bacteriodetes, Verrucomicrobia ve Actinobacteria filumları ile ilişkili bulunmuştur. Cyanobacteria ve Parcubacteria, düşük miktara sahip diğer önemli gruplar arasındadır. Blastopirellula, Luteolibacter, Porhyrobacter ve Hydrogenophaga`ya ait cinsler tüm örneklerde en çok bulunan taksonlardır. Ekim örneklerinde Sandarakinorhabdus, Pseudoanabena, Roseinatronobacter ve Pontimonas cinsine bağlı okumalar da tespit edilmiştir. Mikrobiyal popülasyonların türü ve sayısı açısından örnekler arasında çarpıcı mevsimsel farklılıklar tespit edilmiştir.
Keywords : bor, mikrobiyal çeşitlilik, yüksek verimli dizileme