Phylogenetic analysis for Endemic Fritillaria baskilensis Behçet (Liliaceae): Evidence from cpDNA “trn” sequences

Authors : Pelin YILMAZ SANCAR, Irmak İÇEN TAŞKIN, Murat KURSAT, Ömer MUNZUROĞLU

Pages : 431-441

Doi:10.46309/biodicon.2021.963174

View : 26 | Download : 11

Publication Date : 2021-12-15

Article Type : Research Paper

Abstract :İlk defa 1998 yılında Elazığ’ın Baskil ilçesinden toplanan ve bilim dünyasına yeni tür olarak kazandırılan Fritillaria baskilensis Türkiye’nin endemik ters lale türlerinden biridir. Bu çalışmanın amacı Fritillaria baskilensis’ in diğer Fritillaria türleri ile aralarındaki sistematik ilişkilerin moleküler teknikler kullanarak belirlenmesidir. Ayrıca; söz konusu endemik türün hangi altcinste yer alacağı da bu çalışmanın sonucu olarak ilk defa tarafımızca tespit edilmeye çalışılmıştır. CTAB metodu ile manuel olarak gerçekleştirilen DNA izolasyonu sonrası trna ve trnd primerleri kullanılarak 5 örneğe ait trnT-trnL3’ bölgesi çoğaltılmış, NCBI’ dan elde edilen diğer sekans bilgileri ile birlikte toplam 27 Fritillaria türü 2 dış grup ile birlikte MEGA programında analiz edilmiştir. Analizlerimiz literatürle uyumluluk gösterirken, F. baskilensis’ in Fritillaria altcinsi üyeleri ile aynı kolda yer alması F. baskilensis’in bu altcinste yer aldığı fikrini düşündürmektedir. Bu çalışma F. baskilensis populasyonlarına ait sekans bilgileri kullanılarak yapılmış ilk moleküler tabanlı çalışma olması açısından oldukça önemlidir ve sözkonusu türe ait yeni “trn” gen bölgesi haplotipleri ilk defa tarafımızca tespit edilerek GenBank veritabanına kazandırılmıştır.
Keywords : Fritillaria, Endemik, Turkiye, cpDNA, trnT trnL3