Molecular diversity of ‘Candidatus Phytoplasma’ species in pome and stone fruits in Turkey

Authors : Didem CANİK OREL, Samanta PALTRINIERI, Filiz ERTUNÇ, Assunta BERTACCINI

Pages : 7-14

Doi:10.16955/bitkorb.508890

View : 11 | Download : 5

Publication Date : 2019-03-29

Article Type : Research Paper

Abstract :Ankara ve Isparta illerinden fitoplazma enfeksiyonu benzeri belirti gösteren elma, armut ve kayısı ağaçlarından fitoplazma varlığının saptanmasına yönelik örnekleme yapılmıştır. Toplamda 31 örnek universal ve grup spesifik fitoplazma primerleri ile PCR’a tabi tutulmuş ve elde edilen PCR ürünleri Tru1 I, Rsa I and Ssp I endonükleazları ile kesilmiştir. Elma örnekleri 16SrX-A insert ignore into journalissuearticles values(‘ Candidatus Phytoplasma mali’); ile enfekteli bulunurken armut örneklerinin çoğunluğunda 16SrX-A ve 16SrX-C alt gruplarıyla karışık enfeksiyon saptanmıştır. Kayısı örneklerinde 16SrX-B insert ignore into journalissuearticles values(‘ Candidatus Phytoplasma prunorum’);, 16SrX-C insert ignore into journalissuearticles values(‘ Candidatus Phytoplasma pyri’); ve 16SrX-A/16SrX-C ve 16SrX-C/16SrI insert ignore into journalissuearticles values(aster yellows); alt gruplarının karışık enfeksiyonu saptanmıştır. Bu çalışma ile kayısıda 16SrI, armutta ve kayısıda karışık fitoplazma enfeksiyonları Türkiye’de ilk kez saptanmıştır. 
Keywords : Fitoplazma tespiti, Yumuşak çekirdekliler, Kayısı, Karışık fitoplazma enfeksiyonu, Aster yellows grup