Serological and molecular detection of Leek yellow stripe virus infecting onion (Allium cepa L.) and leek (Allium ampeloprasum L.) in Ankara, Turkey

Authors : Adyatma SANTOSA, Filiz ERTUNÇ

Pages : 49-56

Doi:10.16955/bitkorb.622150

View : 14 | Download : 10

Publication Date : 2020-03-31

Article Type : Research Paper

Abstract :Soğan insert ignore into journalissuearticles values(Allium cepa L.); Türkiye’de yüksek derecede ekonomik öneme sahip olup, Türk menülerinde yaygın olarak kullanılmaktadır. 2018 yılında 1.930.695 tonluk Türkiye üretiminin %25’i Ankara’da yapılmıştır. Son yıllarda soğan tarlalarında virus benzeri belirtiler gözlenmiş ancak Ankara bölgesinde soğan virus hastalıkları üzerine bir çalışma yapılmamıştır. Leek yellow stripe virus insert ignore into journalissuearticles values(LYSV); esas olarak pırasayı insert ignore into journalissuearticles values(Allium ampeloprasum L.); enfekte etmekle birlikte soğanı da hastalandırmakta ve verim düşüklüğüne de neden olmaktadır. 2018 yılı ağustos ayında, tipik virüs belirtisi, örneğin yaprakta şeritler, yaprak deformasyonu, sararma ve cüceleşme belirtileri gösteren 45 soğan örneği ve yapraklarda şiddetli sarı çizgi belirtisi tasıyan 6 pırasa örneği tarladan toplanmıştır. 45 soğan örneğinin 6 tanesi, 6 pırasa örneğinin 2 tanesi DAS-ELISA çalışmalarında LYSV’ye karsı pozitif sonuç vermiştir. Örneklerden elde edilen toplam nükleik asit RT-PCR’da LYSV’ye karşı geliştirilen örtü proteinine spesifik primerlerle amplifiye edilmiştir. 6 soğan ve 2 pırasa örneği RT-PCR çalışmalarında da pozitif sonuç vermiş ve agarose jelde 1020 bp büyüklüğünde bir bant oluşturmuşlardır. Diğer örnekler agarose jelde bir bant oluşturmamış ve bunlar LYSV enfeksiyonu açısından negatif olarak değerlendirilmişlerdir. Yapılan filogenetik analiz sonucunda LYSV Ankara izolatlarının Sırbistan, Arjantin ve Almanya izolatları ile benzerlik gösterdiği görülmüştür. Bu araştırma ile LYSV enfeksiyonu Ankara ilinde ilk olarak kanıtlanmış bulunmaktadır.
Keywords : soğan, pırasa, LYSV, Ankara