Diyarbakır ili domates üretim alanlarındaki bazı önemli virüslerin moleküler yöntemler ile teşhisi ve moleküler karakterizasyonu

Authors : Feyzullah YILMAZ, Murat SİPAHİOĞLU

Pages : 49-58

Doi:10.16955/bitkorb.682860

View : 9 | Download : 6

Publication Date : 2020-12-31

Article Type : Research Paper

Abstract :Diyarbakır ili domates üretim alanlarında Domates sarı yaprak kıvırcıklık virüsü insert ignore into journalissuearticles values(Tomato yellow leaf curl virus, TYLCV);, Patates Y virüsü insert ignore into journalissuearticles values(Potato virus Y, PVY);, Domates mozaik virüsü insert ignore into journalissuearticles values(Tomato mosaic virus, ToMV);, Domates lekeli solgunluk virüsü insert ignore into journalissuearticles values(Tomato spotted wilt virus, TSWV); ve Domates halkalı leke virüsü insert ignore into journalissuearticles values(Tomato ringspot virus, ToRSV);’nün varlığının moleküler yöntemler ile ortaya konulması amacıyla 2018 yılında sürvey çalışmaları yürütülmüştür. TYLCV’nin varlığını araştırmak için PCR yöntemi, PVY ve ToMV’nin varlığını araştırmak için multipleks RT-PCR yöntemi, TSWV ve ToRSV’nin varlığını araştırmak için ise RT-PCR yöntemi kullanılmıştır. Domates üretim alanlarında virüs belirtisi gösteren ve göstermeyen toplam 278 adet bitkiden rastgele yaprak örnekleri toplanmıştır. Moleküler yöntemler ile testlenen örneklerin 56 insert ignore into journalissuearticles values(%20.1);’sının en az bir virüs türü ile enfekteli olduğu tespit edilmiştir. Testlenen örneklerin 41’inin insert ignore into journalissuearticles values(%14.7); ToMV, 21’nin insert ignore into journalissuearticles values(%7.6); PVY ve 6’sının insert ignore into journalissuearticles values(%2.2); ise ToMV+PVY ile karışık enfekteli olduğu saptanmıştır. Çalışma kapsamında yürütülen moleküler testler sonucunda, domates örneklerinde TYLCV, TSWV ve ToRSV enfeksiyonları saptanmamıştır. Tespit edilen PVY ve ToMV izolatlarından rastgele 4’er adet seçilerek PVY izolatlarının kısmi kılıf protein genleri, ToMV izolatlarının kısmı hareket protein ve kılıf protein genleri karakterize edilerek, Gen Bankasına kayıtları yapılmıştır. ToMV izolatları dünyadaki diğer izolatlar ile nükleotid düzeyinde %99-100 arasında benzerlik gösterirken, PVY izolatları %88-99 arasında değişen oranda benzerlik göstermiştir. Yürütülen bu çalışma ile ToMV ve PVY Diyarbakır ili domates üretim alanlarında ilk defa rapor edilmiştir.
Keywords : domates virüsleri, multipleks RT PCR, ToMV, PVY, kılıf protein geni