Prevalence and molecular characterization of Tomato spotted wilt virus in pepper fields in Tokat province

Authors : Şerife TOPKAYA

Pages : 28-35

Doi:10.16955/bitkorb.898371

View : 17 | Download : 6

Publication Date : 2021-09-30

Article Type : Research Paper

Abstract :Çalışma kapsamında 2016 yılı yaz döneminde biber yetiştirilen Tokat ili Merkez, Niksar, Erbaa ve Pazar ilçelerine sürveyler düzenlenmiş ve virüs şüphesi gösteren biber bitkilerinden yaprak örneği toplanmıştır. Sürvey çalışmaları sonucunda toplanan 324 adet bitki yaprak örneği Tomato spotted wilt virus insert ignore into journalissuearticles values(TSWV);’e spesifik antiserum ile DAS-ELISA testine tabii tutulduktan sonra virüse spesifik primerlerle RT-PCR işlemi gerçekleştirilmiştir. Testlenen örneklerin %13’nün TSWV ile enfekteli olduğu tespit edilmiştir. ELISA testinde pozitif çıkan örnekler S segmentinde yer alan Nucleocapsid proteine insert ignore into journalissuearticles values(Np); spesifik primerlerle RT-PCR işlemine tabi tutulmuş ve pozitif bant elde edilen örneklerden 3’ü sekans analizine gönderilmiştir. Analiz sonuçlarına göre Türkiye TSWV izolatlarının Np gen bölgesi Fransa ve Güney Kore izolatları ile %98-99 nükleotid benzerliği göstermiştir ve filogenetik ağaçta aynı grupta kümelenmiştir.Anahtar kelimeler: biber, RT-PCR, Tomato spotted wilt virus, Tokat
Keywords : biber, RT PCR, Tomato spotted wilt virus, Tokat