Identification and Analysis of microRNA-Disease Associations with Kernelized Bayesian Matrix Factorization

Authors : Ahmet TOPRAK, Esma ERYILMAZ DOĞAN

Pages : 40-45

Doi:10.31590/ejosat.980257

View : 23 | Download : 13

Publication Date : 2021-11-30

Article Type : Research Paper

Abstract :Birçok farklı hastalığın başlamasında ve ilerlemesinde etkili olan mikroRNA (miRNA) molekülleri yaklaşık 22 nükleotid uzunluğunda kodla yapmayan bir RNA türüdür. Bilim insanları karmaşık insan hastalıklarının önlenmesi, teşhisi ve tedavisinde miRNA’ların önemini açıklamıştır. Bu nedenle son yıllarda araştırmacılar potansiyel miRNA-hastalık ilişkilerini bulmak için çok çalışmaktalar. miRNA’lar ve hastalıklar arasında yeni ilişkiler bulmak için kullanılan deneysel tekniklerin zaman alıcı ve pahalı olması nedeniyle birçok hesaplama tekniği geliştirilmiştir. Bu çalışmada yeni miRNA-hastalık ilişkilerini tahmin etmek için Kernelized Bayesian matrix factorization (KBMF) tekniğini önerdik. 5-katlı çapraz doğrulama tekniği uyguladık ve 0.9450 ortalama AUC değeri elde ettik. Ayrıca KBMF tekniğinin performansını kanıtlamak için meme, akciğer ve kolon neoplazmalarına dayalı vaka çalışmaları uyguladık. Sonuçlar KBMF’nin olası miRNA-hastalık ilişkilerini ortaya çıkarmak için güvenilir bir hesaplama modeli olarak kullanılabileceğini gösterdi.
Keywords : miRNA, hastalık, miRNA hastalık ilişkisi, benzerlik ölçümü