Effect of Benchmark Datasets on Protein Structure Prediction As a Concept

Home Page
About
Submit A Journal
Submit A Conference
Submit Paper/Book
- Submit a Preprint
- Submit a Book
Contact

Avrupa Bilim ve Teknoloji Dergisi
Issue:29 Special Issue
Effect of Benchmark Datasets on Protein Structure Prediction As a Concept

Effect of Benchmark Datasets on Protein Structure Prediction As a Concept

Pages : 117-121

View : 25 | Download : 11

Publication Date : 2021-12-01

Article Type : Conference Paper

Abstract :Protein yapılarının bilinmesi hayati fonksiyonlarda görev alan proteinlerin görev tanımlarının anlaşılabilmesi, ilaç tasarımı ve daha birçok açıdan öneme sahiptir. Protein yapı tahmini ise laboratuvar ortamında oldukça uzun zaman alan süreci kısaltmak için alternatif bir biyoinformatik alt çalışma alanıdır. Bu alanda geliştirilen yöntemlerin performans analizleri genel itibariyle kıyaslama (benchmark) veri kümeleri üzerinden yapılmaktadır. Veri kümelerinin büyüklüğü algoritma çalışma zamanlarına doğrudan etki etmektedir. Bu çalışmada kapsamında kıyaslama veri kümelerinin sonuçlara nasıl yansıdığı analiz edilmiştir. Çalışma kapsamında iki CB513 ve EVASet olmak üzere iki farklı kıyaslama veri kümesi, JPred ve Porter olmak üzere iki farklı protein yapı tahmini yöntemi kullanılmıştır. Çalışma, protein özellikleri açısından geniş kapsamlı ancak, veri büyüklüğü anlamında olabildiğince az veri içerecek olan benchmark veri kümeleri geliştirme fikri itibariyle sonraki çalışmalar için esin kaynağı niteliğindedir.
Keywords : Protein yapı tahmini, Kıyaslama veri kümesi, Kavram

ORIGINAL ARTICLE URL

VIEW PAPER (PDF)

* There may have been changes in the journal, article,conference, book, preprint etc. informations. Therefore, it would be appropriate to follow the information on the official page of the source. The information here is shared for informational purposes. IAD is not responsible for incorrect or missing information.