Defining phylogenetic relationship between the genera Opopanax and Crenosciadium using nuclear and chloroplast DNA sequence data

Authors : Taner ÖZCAN, Özlem ÇETİN, Mustafa ÇELİK, Fatih ALBAYRAK

Pages : 716-731

Doi:10.25092/baunfbed.930696

View : 19 | Download : 13

Publication Date : 2021-07-04

Article Type : Research Paper

Abstract :Opopanax ve Crenosciadium üzerine filogenetik bir çalışma, cinslerin sınırlarını ve cinsler arası ilişkilerini aydınlatmak için yapıldı. Çekirdek DNA’sından ITS, kloroplast DNA’sından matK ve trnL-F'’den elde edilen dizi verileri, filogenetik ilişkilerini belirlemek için kullanıldı. Tüm bölgelerin Polimeraz Zincir Reaksiyonu (PCR) amplifikasyonları evrensel primerler kullanılarak yapıldı. Maksimum Olabilirlik (ML) ağaçları, PAUP* yazılımı kullanılarak oluşturuldu, ITS dizilerinin nod yaşlarını gösteren bir diğer filogenetik ağacı MrBayes programından elde edildi ve Komşu Ağ Diyagramları, Splits Tree Programı kullanılarak oluşturuldu. Sonuçlarımız, Smyrniopsis ve Opopanax'ın Petroedmondia syriaca, Magydaris panacifolia ve Crenosciadium siifolium ile güçlü bir şekilde yakın ilişkili olduğunu açıkça gösterdi.
Keywords : Opopanax, Crenosciadium, Apiaceae, Filogeni