Türkiye’de Yetiştirilen Bazı Sığır Irklarında Asetil Koenzim A Dehidrogenaz Geni (g.2885C>A) Polimorfizminin ARMS-PCR Yöntemiyle Belirlenmesi

Authors : Taki KARSLI

Pages : 25-29

View : 45 | Download : 7

Publication Date : 2019-07-02

Article Type : Research Paper

Abstract :Asetil koenzim A dehidrogenaz insert ignore into journalissuearticles values(ACADVL); uzun zincirli yağ asitlerinin oksidasyonunda ve enerji salınımında önemli rol oynayan bir proteindir. Sığırlarda 19. kromozom üzerinde bulunan ACADVL geni üzerindeki bir SNP’in insert ignore into journalissuearticles values(g.2885C>A; Pro236Thr); bazı büyüme özellikleri insert ignore into journalissuearticles values(göğüs genişliği, göğüs derinliği ve sağrı genişliği); ile ilişkili olduğu belirlenmiştir. Bu gen için AA genotipli bireyler AC ve CC genotiplilere göre daha üstün büyüme özelliklerine sahiptir. Bu çalışmada Türkiye’ de yetiştirilen Siyah Alaca insert ignore into journalissuearticles values(SA);, Yerli Kara insert ignore into journalissuearticles values(YK);, Boz insert ignore into journalissuearticles values(BI); ve Doğu Anadolu Kırmızısı insert ignore into journalissuearticles values(DAK); sığır ırklarında ACADVL insert ignore into journalissuearticles values(g.2885C>A); geni üzerinde bulunan polimorfizmin ARMS-PCR yöntemiyle belirlenmesi hedeflenmiştir. Çalışmada SA insert ignore into journalissuearticles values(64 örnek);, YK insert ignore into journalissuearticles values(54 örnek);, BI insert ignore into journalissuearticles values(48 örnek); ve DAK insert ignore into journalissuearticles values(44 örnek); sığır ırklarına ait toplam 210 örnek incelenmiştir. ARMS-PCR analizleri sonucunda ACADVL insert ignore into journalissuearticles values(g.2885C>A); geni için Siyah Alaca ırkı monomorfik insert ignore into journalissuearticles values(CC-307-152 bç); bulunurken BI, DAK ve YK sığır ırkları polimorfik insert ignore into journalissuearticles values(AC: 307-211-152 bç ve CC: 307-152 bç); bulunmuştur. AC genotipinin frekansı BI, DAK ve YK sığır ırklarında sırasıyla 0.063, 0.045, 0.093 olarak hesaplanırken, CC genotipinin frekansı sırasıyla 0.937, 0.955 ve 0.907 olarak hesaplanmıştır. Yapılan bu çalışma ile SA, BI, DAK ve YK sığır ırklarında ACADVL genindeki polimorfizmler ilk defa gösterilmiştir. Çalışılan sığır ırklarında AA genotipi tespit edilememiştir.
Keywords : ACADVL geni, ARMS PCR, polimorfizm

ORIGINAL ARTICLE URL