Molecular identification of Fusarium spp. causing wilt of chickpea and the first report of Fusarium redolens in Turkey

Authors : Mücella TEKEOĞLU, Hilal ÖZKILINÇ, Berna TUNALI, İsmail KÜSMENOĞLU, Weidong CHEN

Pages : 27-33

View : 13 | Download : 9

Publication Date : 2017-04-04

Article Type : Research Paper

Abstract :Normal 0 21 false false false TR X-NONE X-NONE /* Style Definitions */ table.MsoNormalTable {mso-style-name:`Normal Tablo`; mso-tstyle-rowband-size:0; mso-tstyle-colband-size:0; mso-style-noshow:yes; mso-style-priority:99; mso-style-qformat:yes; mso-style-parent:``; mso-padding-alt:0cm 5.4pt 0cm 5.4pt; mso-para-margin:0cm; mso-para-margin-bottom:.0001pt; mso-pagination:widow-orphan; font-size:11.0pt; font-family:`Calibri`,`sans-serif`; mso-ascii-font-family:Calibri; mso-ascii-theme-font:minor-latin; mso-fareast-font-family:`Times New Roman`; mso-fareast-theme-font:minor-fareast; mso-hansi-font-family:Calibri; mso-hansi-theme-font:minor-latin; mso-bidi-font-family:`Times New Roman`; mso-bidi-theme-font:minor-bidi;} Nohut insert ignore into journalissuearticles values( Cicer arietinum L.); önemli bir yemeklik baklagil türüdür ve Fusarium oxysporum f. sp. ciceris tarafından neden olunan Fusarium solgunluğu Türkiye’de en önemli nohut hastalıklarından biridir. Fusarium redolens ’in bazı ülkelerde nohutta solgunluk benzeri hastalığa neden olduğu bilinmektedir, ancak Türkiye’den rapor edilmemiştir. Patojen tür ve ırklarının doğru tanımlanması, hastalık yönetimi için dayanıklı çeşit geliştirme ve kullanımında önemlidir. Nohutta solgunluğa neden olan kırkbeş Fusarium spp. izolatı 2007’den 2009’a kadar Türkiye’deki 10 ilden elde edilmiştir. Bu izolatların tür seviyesinde tanımlamaları F. oxysporum f. sp. ciceris ve F. redolens için spesifik PCR primerleri ve Translation Elongation Factor 1-α insert ignore into journalissuearticles values( Ef-1α ); gen bölgesinin sekanslanması ile yapılmıştır. İzolat koleksiyonunda, tür spesifik primerlerle yapılan PCR’a göre, sekiz izolat F. redolens ve onbir izolat F. oxysporum f. sp. ciceris olarak tanımlanmıştır. Onbir F. oxysporum f. sp. ciceris izolatının yedisi ırk-spesifik primerlerle yapılan PCR’a göre ırk 0 olarak tanımlanmıştır. Ayrıca, F. oxysporum f. sp. ciceris ırk-spesifik ve F. redolens tür-spesifik primerlerle ürün vermeyen izolatların tanımlamalarında Ef-1α bölgesinin sekans verisi kullanılmıştır. Bu, Türkiye’de nohutta solgunluğa neden olan F. redolens ’in ilk raporudur.
Keywords : Nohut, Fusarium oxysporum, Fusarium redolens, Irk spesifik primerler, Tür spesifik primerler