Integrative Analysis of SIX1 and Cancer Stem Cell Markers in Hepatocellular Carcinoma

Authors : Pelin BALÇIK ERÇİN

Pages : 325-330

Doi:10.34087/cbusbed.689797

View : 18 | Download : 13

Publication Date : 2020-09-30

Article Type : Research Paper

Abstract :Amaç: SIX1 transkripsiyon faktörünün çeşitli memeli tümörlerinde anormal anlatımı ve SIX1’in kanser kök hücre karakterinde rol oynadığı son çalışmalarda belirlenmiştir. Bununla birlikte, HCC kanser kök hücrelerinde SIX1 transkripsiyon faktörünün rolü halen belirsizdir. Bu çalışmanın amacı, EMT-uyarıcı SIX1 ve kanser kök hücre belirteçlerinin anlatım profillerinin in-vitro ve in-vivo analizlerde değerlendirilmesidir. Gereç ve Yöntemler: SIX1 anlatımı, SNU398 HCC hücre hattında shRNA transdüksiyonu ile baskılandı. Tumor-küre formasyonu analizi, kanser kök hücre analizi için kullanılan önemli bir yöntemdir. SIX1-bağımlı kanser kök hücre belirteçleri PROM1, EPCAM ve OCT4 gen anlatım profilleri tümör-küre modelinde RT-qPCR ile değerlendirildi. Siroz ve HCC doku örneklerindeki transkriptom verilerinde genlerin anlatım ve korelasyon analizleri gerçekleştirildi. Bulgular: Kanser kök hücre belirteçlerinin SIX1-baskılanmış anlatımının değerlendirilmesi sonucunda PROM1 ve EPCAM anlatımlarının anlamlı artmasına karşın OCT4 anlatımının anlamlı olarak azaldığı belirlendi. HCC doku transkriptom analizinde SIX1 anlatımı ile PROM1 ve EPCAM anlatımının ters korelasyon, OCT4 anlatımında pozitif korelasyon tespit edildi. İlginç olarak aynı gen ifadelerinin siroz örneklerinde OCT4 dışındaki diğer genlerin anlatımlarında farklı paternler saptanmıştır. SIX1, EPCAM, PROM1 ve OCT4 gen mRNA profillerinde siroz ve HCC numuneleri arasında anlamlı farklılık saptanmadı. Sonuç: Kanser kök hücreleri kendi kendini yenileyebilen ve kanserin ilerlemesinde rol oynayan hücrelerdir. Çalışma sonucunda SIX1 ve kanser kök hücre ile ilişkili genlerin anlatım profillerinin aydınlatılması, HCC’nin moleküler yapısı hakkındaki bilgilerimizi geliştirmektedir.
Keywords : SIX1, EMT, CSC, HCC