Frankliniella occidentalis (Pergande) (Thysanoptera:Thripidae) tarafından taşınan Tospovirüslerin Moleküler Tespitinde RT-qPCR yönteminin uygulanması

Authors : Murat Kemal Avcı, Ferhat Kiremit, Eyyüp Mennan Yıldırım

Pages : 187-193

Doi:10.25308/aduziraat.1523822

View : 42 | Download : 66

Publication Date : 2024-12-31

Article Type : Research Paper

Abstract :Frankliniella occidentalis Pergande (Thysanoptera: Thripidae) polifag bir tür olup, pamuk, çilek, domates ve süs bitkileri gibi birçok tarımsal üründe zararlara yol açabilmektedir. F. occidentalis bitkilerin çiçeklerindeki özsuyunu emmek suretiyle çiçeklerin erken dökülmesine ve verim düşüklüğüne neden olmaktadır. Ayrıca virüs vektörü olması nedeniyle bitkilerde dolaylı yoldan da zarar yapabilmektedir. Bu çalışmanın amacı, Aydın ili için ekonomik öneme sahip çileklerden elde edilen tripslerde vektörü oldukları tospovirüslerin varlığının RT-qPCR yöntemiyle tespit edilmesidir. Bu amaçla ilk olarak çilek bitkilerinin çiçeklerinden elde edilen tripslerin PCR-RFLP protokolüyle moleküler tanılaması yapıldıktan sonra RNA izolatları elde edilerek RT-qPCR yöntemiyle tospovirüslerin varlığı tespit edilmiştir. Çalışma sonucunda; elde edilen verilerle, eldeki örneklerin F. occidentalis olduğu ve bu böceklerle taşınan virüslerin de tospovirüs olduğu tespit edilmiştir. Her iki yöntem (PCR-RFLP ve RT-qPCR) hızlı ve güvenilir sonuç vermesi açısından, hem trips tespiti hem de tospovirüs tespiti amacıyla önümüzdeki çalışmalarda kullanılmak için ümitvar görünmektedir.
Keywords : Frankliniella occidentalis, RFLP, Tospovirüs, RT-qPCR