Pektolinarigenin'in Antioksidan Aktivitesi: DFT Çalışmaları, Hirshfeld Yüzey Analizi, Moleküler Kenetleme Araştırması ve ADME/T Tahmini

Authors : Tugba Göcen

Pages : 1018-1031

Doi:10.35414/akufemubid.1641818

View : 29 | Download : 60

Publication Date : 2025-10-01

Article Type : Research Paper

Abstract :Pektolinarigenin’in (5,7-dihidroksi-6,4\\\'-dimetoksiflavon) potansiyel bir antioksidan ilaç adayı olarak değerlendirilmesi amacıyla moleküler yapı parametreleri, elektronik ve kimyasal reaktivite tanımlayıcıları belirlemek için yoğunluk fonksiyoneli teorisi (DFT) kullanılanılarak hesaplanmıştır. B3LYP/6-311G(d,p) baz seti ile optimize edilen moleküler yapı, literatürde rapor edilen X-ışını kristal yapısı ile karşılaştırılmıştır. Ayrıca, kristal yapısındaki moleküller arası etkileşimler, üç boyutlu Hirshfeld yüzeyi ve iki boyutlu parmak izi çizimleri ile görselleştirilmiştir. Molekülün elektrostatik potansiyel haritası (MEP), sınır moleküler orbitalleri (FMOs) ve Mulliken atomik yükleri hesaplanarak kimyasal olarak aktif bölgeler belirlenmiştir. Ek olarak, Pektolinarigenin’in vücudun antioksidan savunma sisteminin aktivasyonunda rol oynayan NADPH oksidaz enzimi (PDB ID: 2CDU) ile afinitesini değerlendirmek amacıyla moleküler kenetleme çalışması yapılmıştır. Bu analizler, Pektolinarigenin’in hedef proteinin aktif bölgesiyle güçlü bir etkileşim gösterdiğini ve -8.5 kcal/mol bağlanma enerjisiyle yüksek bir bağlanma afinitesine sahip olduğunu ortaya koymuştur. Ayrıca, farmakokinetik özellikler ve ilaç benzerliği analizleri, Pektolinarigenin’in antioksidan ilaç olarak geliştirilmesi için uygun bir aday olduğunu göstermektedir.
Keywords : Flavonoid, DFT, Antioksidan, Hirshfeld yüzey analizi, Moleküler kenetleme, ADMET

ORIGINAL ARTICLE URL